结论：干了三天被扣商保（商业保险费用）是否正常，不能一概而论，需结合具体情况判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、从劳动合同或公司规章制度的角度
若劳动合同或公司规章制度中有明确规定：
- 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了员工在试用期内或工作不满一定天数（如三天）时，需要承担商业保险费用，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司扣除商保费用可能是合理的。但即便如此，公司也应确保该规定的合法性和合理性，并提前告知员工。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三条，订立劳动合同，应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。如果公司规章制度或劳动合同中的相关条款是双方协商一致的结果，且不违反法律强制性规定，那么该条款对双方具有约束力。
若劳动合同或公司规章制度中无明确规定：
- 如果劳动合同或公司规章制度中没有明确规定员工需要承担商业保险费用，或者规定不明确，那么公司扣除商保费用可能缺乏合法依据。在这种情况下，员工有权要求公司退还扣除的费用。
二、从商业保险的性质和目的角度
商业保险是公司为员工提供的福利：
- 商业保险通常被视为公司为员工提供的一种福利，旨在为员工提供额外的保障。如果公司要求员工承担商业保险费用，尤其是对于只工作了三天的员工来说，可能不符合商业保险作为福利的初衷。
商业保险费用的承担应合理：
- 即使公司要求员工承担部分商业保险费用，也应确保费用的承担是合理的。例如，可以根据员工的工作年限、职位等因素来确定员工应承担的费用比例。对于只工作了三天的员工来说，要求其承担全部或大部分商保费用显然是不合理的。
三、从实际操作和公平性的角度
实际操作中的合理性：
- 从实际操作的角度来看，公司扣除只工作了三天员工的商保费用可能面临操作上的困难。例如，如何准确计算员工应承担的费用比例、如何确保费用的扣除符合相关法律法规等。
公平性的考量：
- 从公平性的角度来看，要求只工作了三天的员工承担商保费用可能对员工不公平。员工在短时间内为公司做出的贡献有限，却要承担与长期员工相同的商保费用，这显然是不合理的。
四、建议与行动
与公司沟通：
- 如果你认为公司扣除商保费用不合理，首先可以尝试与公司进行沟通，了解公司扣除费用的具体原因和依据。如果公司能够提供合理的解释和依据，你可以考虑接受；如果公司无法提供合理的解释和依据，你可以进一步采取行动。
向劳动监察部门投诉：
- 如果与公司沟通无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉。劳动监察部门会依法对公司的行为进行调查和处理，并保护你的合法权益。
寻求法律援助：
- 如果问题较为复杂或涉及金额较大，你可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师（比如我，康煜丰律师，专注于交通事故、工伤赔偿领域）。我可以根据你的具体情况为你提供专业的法律建议和帮助。
总结：干了三天被扣商保是否正常需结合具体情况判断。如果劳动合同或公司规章制度中有明确规定且合理合法，那么公司扣除商保费用可能是合理的；如果无明确规定或规定不合理，那么公司扣除商保费用可能缺乏合法依据。在这种情况下，你可以与公司沟通、向劳动监察部门投诉或寻求法律援助来维护自己的合法权益。