关于异地上游虚开已判刑，下游由当地还是异地查的问题，结论是下游案件的查处既可能由当地（即下游企业所在地）的税务或公安机关进行，也可能由异地（如上游企业所在地或共同上级机关指定的地点）的税务或公安机关查处，具体取决于案件的具体情况和相关机关的管辖权安排。以下从不同角度详细分析：
管辖权原则：
- 在刑事案件中，管辖权通常遵循“犯罪地管辖”为主，“居住地管辖”为辅的原则。犯罪地包括犯罪行为发生地和犯罪结果发生地。对于虚开发票案件，上游企业的虚开行为地和下游企业的接受虚开发票地都可能被视为犯罪地。
- 因此，下游企业所在地的公安机关或税务机关有权对下游企业涉嫌接受虚开发票的行为进行调查。同时，如果上游企业所在地的公安机关或税务机关认为有必要，也可以对下游企业进行调查，尤其是在涉及跨区域、大规模虚开发票案件时。
案件具体情况：
- 如果下游企业涉嫌接受虚开发票的行为与上游企业的虚开行为紧密相关，且上游企业已经被判刑，那么下游企业的案件可能会被视为同一案件的延续或相关部分，从而由异地（如上游企业所在地）的公安机关或税务机关进行查处。
- 如果下游企业涉嫌接受虚开发票的行为相对独立，与上游企业的虚开行为关联不大，或者下游企业所在地的公安机关或税务机关已经掌握了充分的证据，那么下游企业的案件可能会由当地（即下游企业所在地）的公安机关或税务机关进行查处。
共同上级机关的指定：
- 在涉及跨区域、大规模虚开发票案件时，为了协调各方行动、提高查处效率，共同上级机关（如省级公安机关或税务机关）可能会指定某个地区的公安机关或税务机关对下游企业进行查处。
法律建议：
- 如果您或您的企业涉嫌接受虚开发票，并面临税务或公安机关的调查，建议积极配合调查工作，如实提供相关证据和资料。
- 同时，您可以咨询专业律师（如我，李亚辉律师，专注于刑事辩护、婚姻家庭领域），了解您的权利和义务，以及可能面临的法律后果。律师将根据您的具体情况，为您提供专业的法律建议和辩护策略。
可能后果：
- 如果下游企业被查实涉嫌接受虚开发票，可能会面临税务机关的行政处罚，如罚款、没收违法所得等。
- 如果情节严重，构成犯罪的，还可能面临刑事处罚，如有期徒刑、罚金等。因此，务必重视此类案件的查处工作，及时寻求法律帮助。