结论：员工仲裁输了，赔偿是否按公司方案算，这并非绝对，需根据具体情况来判断。以下从多个角度进行分析：

1. 仲裁裁决的效力：

   • 仲裁裁决一旦作出，即具有法律效力，双方当事人应当履行。如果仲裁裁决中明确规定了赔偿的金额或计算方式，且该裁决未被法院撤销或变更，那么员工应当按照裁决结果来接受赔偿，而不是单纯按照公司的方案来算。
   • 如果员工对仲裁裁决不服，可以在法定期限内向人民法院提起诉讼，请求法院对赔偿问题进行重新审理。在诉讼过程中，法院将根据事实和法律作出判决，该判决将替代仲裁裁决的效力。

2. 公司方案的合法性：

   • 即使仲裁输了，如果公司的赔偿方案违反了法律法规的强制性规定，或者存在显失公平、欺诈、胁迫等情形，员工仍然有权拒绝接受该方案，并可以通过法律途径维护自己的合法权益。
   • 例如，如果公司提出的赔偿金额明显低于法定标准，或者要求员工放弃某些法定权利作为赔偿的条件，这样的方案很可能是不合法的，员工可以不予接受。

3. 双方协商的可能性：

   • 在仲裁或诉讼过程中，双方当事人仍然可以通过协商来解决赔偿问题。如果双方能够达成一致意见，并签订书面协议，那么该协议将具有法律效力，双方应当按照协议内容来履行。
   • 协商解决赔偿问题的好处在于可以节省时间和成本，避免进一步的法律纠纷。但需要注意的是，协商过程中应当保持平等、自愿的原则，任何一方都不得强迫对方接受不合理的条件。

4. 后续法律救济途径：

   • 如果员工认为仲裁裁决或法院判决存在错误，或者公司的赔偿方案仍然不合理，员工还可以考虑通过其他法律途径来维护自己的权益。例如，可以向劳动监察部门投诉、申请再审或者提起上诉等。

建议：

• 对于员工而言，在仲裁输了之后，不要急于接受公司的赔偿方案，而是应当仔细审查该方案的合法性和合理性。如果认为方案存在问题，可以及时向专业律师咨询，了解自己的法律权益和可能的救济途径。
• 同时，员工也应当保留好相关证据材料，如劳动合同、工资单、仲裁裁决书等，以便在后续的法律程序中证明自己的主张。

法律后果：

• 如果员工拒绝接受合法的仲裁裁决或法院判决，并继续通过不合法的方式维权，可能会面临法律制裁的风险，如被法院强制执行、承担诉讼费用等。
• 相反，如果员工能够理性对待仲裁或诉讼结果，并通过合法途径维护自己的权益，那么更有可能获得公正合理的赔偿。

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