作为有丰富经验的律师，针对您提出的“外卖吃出肠胃炎，要求赔偿1000元，商家该怎么处理”这一问题，我的分析如下：

1. 商家应首先核实情况：

   • 商家在接到消费者投诉后，应第一时间核实消费者反映的情况是否属实。这包括确认消费者是否确实在该商家处购买了外卖，以及外卖中是否存在可能导致肠胃炎的不洁物质或过期食材。
   • 商家可以通过查看订单记录、监控录像（如有）、与配送员沟通等方式进行核实。

2. 商家应积极与消费者沟通：

   • 在核实情况后，商家应主动与消费者取得联系，表达歉意，并询问消费者的具体诉求和身体状况。
   • 商家应展现出解决问题的诚意，避免与消费者产生争执或推诿责任。

3. 商家应评估赔偿金额：

   • 如果商家确认自身存在过错，导致消费者因食用外卖而患上肠胃炎，那么商家应考虑对消费者进行赔偿。
   • 赔偿金额应根据消费者的实际损失（如医疗费用、误工费等）以及商家的过错程度来合理确定。对于消费者提出的1000元赔偿要求，商家可以评估其合理性，如果认为过高或过低，可以与消费者进行协商。
   • 若消费者能提供充分证据（如医疗证明、费用单据等）证明其因食用外卖而遭受的实际损失超过1000元，且商家的过错明显，那么商家应考虑按照实际损失进行赔偿，甚至可能超过1000元。
   • 若消费者无法提供充分证据，或者其实际损失明显低于1000元，那么商家可以与消费者协商一个更合理的赔偿金额。

4. 商家应采取措施防止类似事件再次发生：

   • 商家应对此次事件进行深入分析，找出导致外卖不洁的原因，并采取相应的改进措施。
   • 商家可以加强食材采购、储存、加工等环节的卫生管理，提高外卖包装的密封性和保温性，以及加强对配送员的培训和管理等。

5. 若协商无果，可寻求法律途径解决：

   • 如果商家与消费者在赔偿金额上无法达成一致，或者消费者对商家的处理态度不满意，那么双方可以寻求法律途径解决争议。
   • 商家可以咨询专业律师（比如我），了解自身的法律责任和权益，以及可能的法律后果和应对策略。

总结建议：商家在处理此类事件时，应本着诚信、负责的态度，积极与消费者沟通协商，合理确定赔偿金额，并采取措施防止类似事件再次发生。如果遇到法律难题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况为您提供专业的法律建议。