在职期间因克扣工资，你是可以申请劳动仲裁的。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者享有取得劳动报酬的权利，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。如果用人单位克扣或者无故拖欠劳动者工资，劳动者有权依法维护自己的合法权益，其中就包括申请劳动仲裁。

二、申请劳动仲裁的条件

1. 存在劳动关系：你必须是与用人单位存在劳动关系的劳动者，这是申请劳动仲裁的前提条件。
2. 克扣工资事实：你需要有证据证明用人单位确实存在克扣工资的行为，比如工资条、银行转账记录、与用人单位的沟通记录等。
3. 未超过仲裁时效：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，你需要在发现克扣工资行为后的一年内申请劳动仲裁。

三、申请劳动仲裁的流程

1. 准备证据材料：包括劳动合同、工资条、银行转账记录、与用人单位的沟通记录等，以证明用人单位克扣工资的事实。
2. 提交仲裁申请：向用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，并附上相关证据材料。
3. 参加仲裁庭审：仲裁委员会会安排庭审，你需要按时参加，并在庭审中陈述事实、提供证据、进行辩论等。
4. 等待仲裁裁决：仲裁委员会会根据庭审情况作出裁决，如果裁决支持你的请求，用人单位需要按照裁决结果支付你被克扣的工资及可能的赔偿金。

四、可能的法律后果

1. 用人单位支付被克扣的工资：如果仲裁裁决支持你的请求，用人单位需要按照裁决结果支付你被克扣的工资。
2. 用人单位支付赔偿金：根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，如果用人单位克扣工资的行为构成违法，除了支付被克扣的工资外，还可能需要支付赔偿金。
3. 用人单位承担仲裁费用：在劳动仲裁中，仲裁费用通常由败诉方承担。因此，如果仲裁裁决支持你的请求，用人单位可能需要承担仲裁费用。

五、建议与提醒

1. 及时收集证据：一旦发现用人单位存在克扣工资的行为，应尽快收集相关证据材料，以便在申请劳动仲裁时提供有力支持。
2. 咨询专业律师：虽然你可以自行申请劳动仲裁，但咨询专业律师可以让你更好地了解自己的权益和可能的法律后果，以及如何更有效地维护自己的权益。不过，既然你已经在向我咨询，我会尽我所能为你提供专业的法律建议。
3. 保持冷静与理性：在处理劳动争议时，保持冷静与理性非常重要。避免与用人单位发生不必要的冲突或争执，以免影响自己的权益维护。

如果你在职期间因克扣工资而想要申请劳动仲裁，可以按照上述流程进行操作。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。