若公司已进入破产程序，采购员拿回扣的行为属于违法行为，可通过刑事报案、民事追偿及破产程序追缴三种途径处理。具体分析如下：

1. 刑事追责路径
   根据《刑法》第163条，采购员利用职务便利索取或非法收受回扣，数额较大的构成非国家工作人员受贿罪。公司破产管理人可代表公司向公安机关报案，追究其刑事责任。若回扣涉及行贿方，可同时追究行贿方对非国家工作人员行贿罪（《刑法》第164条）。需注意：刑事立案标准为个人受贿6万元以上（根据最新司法解释），但即使未达刑事标准，仍可通过民事途径追偿。

2. 民事追偿路径
   采购员收取回扣的行为违反《民法典》第154条关于”恶意串通损害他人合法权益”的规定，所得利益应返还公司。破产管理人可依据《企业破产法》第34条，向法院提起追回权诉讼，要求采购员返还回扣款项及同期银行贷款利息。若回扣已转移至第三方，需证明第三方明知或应知回扣性质，否则可能面临执行障碍。

3. 破产程序特殊处理
   根据《企业破产法》第36条，管理人有权追回债务人财产。具体操作包括：

   • 立即冻结采购员银行账户及关联财产
     
   • 调取采购合同、付款凭证等证据链
     
   • 向法院申请对采购员采取限制高消费等措施
     
   • 将追回款项纳入破产财产分配
     

实务建议：

1. 立即委托会计师事务所进行专项审计，固定回扣证据链
   
2. 同步向公安机关经侦部门报案，争取刑事立案
   
3. 在破产债权申报期内，向管理人申报追回权债权
   
4. 若涉及关联交易，可依据《公司法》第21条追究控股股东责任
   

需特别提醒：若公司存在管理失职（如未建立反贿赂制度），可能影响追偿效果。建议结合公司章程、内部审批流程等证据，证明采购员行为超出正常职务范围。具体操作方案需根据回扣金额、资金流向等细节进一步设计。