针对您提出的“采购货款被公司人员吃回扣怎么处理”的问题，这是一个涉及法律、公司管理和职业道德的复杂议题。以下是我为您提供的详细解答：
一、法律层面的处理
民事责任：
- 如果公司有明确的规章制度禁止回扣行为，并且该采购员的行为违反了这些规定，公司有权依据《劳动合同法》解除与该采购员的劳动合同，并要求其返还不当得利，同时赔偿因回扣行为给公司造成的经济损失。
- 若回扣行为影响了采购合同的正常履行，损害了供应商的权益，公司还可能需根据《民法典》对供应商承担违约责任，赔偿相应损失。
行政责任：
- 根据《反不正当竞争法》，采购员利用职务之便收受回扣可能构成商业贿赂。监督检查部门将对此类行为进行查处，没收违法所得，并处以罚款；情节严重者，还可能吊销公司的营业执照。
刑事责任：
- 如果采购员的行为构成《刑法》中的非国家工作人员受贿罪，即利用职务便利非法收受他人财物，为他人谋取利益，且数额较大（一般6万元以上），将面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役和罚金等。
二、公司层面的处理
内部调查：
- 公司应立即启动内部调查程序，收集相关证据，确认回扣行为的存在和具体细节。
纪律处分：
- 根据公司规章制度，对涉事采购员给予相应的纪律处分，如警告、记过、降职、解雇等。
制度完善：
- 审查并完善公司的采购流程和内部控制制度，确保采购过程的透明度和公正性，防止类似事件再次发生。
员工培训：
- 加强对员工的职业道德和法律法规培训，提高员工的法律意识和合规意识。
三、实际操作中的注意事项
证据收集：
- 在处理回扣问题时，公司应注重证据的收集和保存，确保处罚措施的合法性和有效性。
法律咨询：
- 在处理复杂或严重的回扣案件时，公司应咨询专业律师的意见，确保处理过程符合法律法规要求。
公开透明：
- 在处理回扣问题时，公司应保持公开透明的态度，及时向员工和股东通报处理进展和结果，维护公司的声誉和信誉。
四、预防措施
建立反腐败政策：
- 公司应制定明确的反腐败政策，明确禁止任何形式的回扣和不当利益输送。
加强监督和管理：
- 加强对采购过程的监督和管理，确保采购活动的合规性和透明度。
鼓励举报：
- 建立举报机制，鼓励员工积极举报回扣等违规行为，对举报人给予保护和奖励。
综上所述，处理采购货款被公司人员吃回扣的问题需要公司从法律、管理和预防等多个层面入手，确保处理过程的合法性和有效性，同时维护公司的声誉和信誉。希望这些建议能对您有所帮助。