结论：工作期间在非洲传染疟疾是否算工伤，需结合具体情况判断，若能证明疟疾与工作有直接因果关系，且符合当地工伤认定条件，则可能被认定为工伤；反之，则可能不被认定。以下从不同角度详细分析：
一、工伤认定的一般原则
根据《工伤保险条例》及相关规定，工伤认定通常遵循“三工”原则，即工作时间、工作场所、因工作原因。若员工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害或患职业病，应认定为工伤。然而，疟疾作为一种传染病，其认定工伤的复杂性在于需证明疾病与工作之间的直接因果关系。
二、疟疾与工作因果关系的证明
工作性质与疟疾风险：
- 若员工的工作性质决定了其需长期在疟疾高发区（如非洲某些地区）工作，且该地区疟疾传播风险高，那么员工感染疟疾与工作之间可能存在直接因果关系。
- 例如，从事野外勘探、援建项目、医疗援助等工作的员工，因工作需要长期暴露在疟疾传播环境中，感染风险显著增加。
工作安排与疟疾感染：
- 若员工感染疟疾是由于公司安排的工作任务导致的，如公司要求员工前往疟疾高发区工作，且未提供必要的防疟措施或保障，那么员工感染疟疾可能被视为工作原因。
- 反之，若员工私自前往疟疾高发区旅游或处理个人事务，期间感染疟疾，则与工作无直接关联。
医学证明与因果关系：
- 员工需提供医学证明，证明其感染的疟疾与工作有直接因果关系。这通常需要专业的医疗机构出具诊断证明，并说明感染途径、时间等与工作相关的信息。
三、当地工伤认定条件与程序
当地法律法规：
- 不同国家和地区对工伤认定的条件和程序可能有所不同。员工需了解并遵守当地的相关法律法规，按照规定的程序申请工伤认定。
- 例如，某些国家可能要求员工在感染疾病后的一定时间内向相关部门报告，并提供必要的证明材料。
工伤认定程序：
- 员工通常需向当地的劳动保障部门或工伤保险机构提交工伤认定申请，并提供相关证明材料。
- 劳动保障部门或工伤保险机构将根据员工提交的材料和当地法律法规进行审查，并作出是否认定为工伤的决定。
四、实际案例与司法实践
- 在实际案例中，法院或劳动保障部门会综合考虑员工的工作性质、工作安排、医学证明以及当地法律法规等因素，来判断员工感染疟疾是否与工作有直接因果关系。
- 若员工能提供充分的证据证明其感染疟疾与工作有直接关联，且符合当地工伤认定条件，那么其申请工伤认定成功的可能性较大。
五、建议与措施
预防措施：
- 公司应为员工提供必要的防疟措施和保障，如提供防疟药物、蚊帐等防护用品，以及安排员工接受防疟知识培训。
- 员工也应自觉采取防疟措施，如使用防蚊液、穿长袖衣物等。
及时报告与申请：
- 若员工在非洲工作期间感染疟疾，应及时向公司报告，并按照当地法律法规和公司规定申请工伤认定。
- 员工应保留好相关证明材料，如医疗诊断证明、工作安排记录等，以便在申请工伤认定时提供。
法律咨询与援助：
- 若员工在申请工伤认定过程中遇到困难或争议，可寻求专业律师的法律咨询与援助，以维护自身合法权益。
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