农民工工资专用账户一般应在工程所在地开立。以下从不同角度进行分析：
政策法规依据：
- 根据《保障农民工工资支付条例》以及相关地方性法规和部门规章，为确保农民工工资能够及时、足额支付，通常要求施工总承包单位在工程项目所在地银行开设农民工工资专用账户。这一规定旨在加强对农民工工资支付的监管，便于工程所在地的人力资源社会保障行政部门等相关部门进行监督和管理，保障农民工的合法权益。例如，某省出台的具体实施细则中明确规定，施工总承包单位应当自工程取得施工许可证（开工报告批复）之日起20个工作日内，在工程项目所在地银行开设农民工工资专用账户，并书面报告当地人力资源社会保障行政部门和相关行业工程建设主管部门。
实际操作便利性：
- 从实际操作的角度来看，在工程所在地开立农民工工资专用账户更有利于工资的发放和管理。工程所在地的银行与工程项目的管理方、建设单位等联系更为紧密，便于各方之间的资金往来和沟通协调。同时，也方便农民工在当地银行办理工资卡等业务，减少因跨地区办理业务带来的不便和成本。比如，在一个大型建筑项目中，农民工来自不同地区，如果在工程所在地开立专用账户，农民工可以在项目附近的银行网点办理工资卡，方便查询工资到账情况和进行取款等操作。
监管有效性：
- 工程所在地的相关部门对工程项目的实际情况更为了解，在工程所在地开立专用账户有助于加强对工资支付情况的实时监管。相关部门可以及时掌握工资发放的时间、金额等信息，一旦发现拖欠工资等违法行为，能够迅速采取措施进行查处，保障农民工的合法权益。例如，当地劳动监察部门可以定期对农民工工资专用账户的资金流动情况进行检查，确保工资按时足额发放。