结论：工程款低于拍卖物价时，能否以资抵债以及后续如何处理，需分情况讨论，具体如下：

1. 双方协商一致以资抵债
   若债权人与债务人（如承包方与发包方）就“以资抵债”达成书面协议，且抵债资产（如房产、设备等）的权属清晰、无争议，即使工程款低于拍卖物价，双方仍可按协议履行。此时需注意：

   • 协议需明确抵债资产的范围、价值评估方式（如双方认可的评估报告）、交付时间及过户义务；
     
   • 若抵债资产价值显著高于工程款，债务人可要求债权人返还差额；若低于工程款，债权人可保留追偿剩余债务的权利；
     
   • 协议需符合《民法典》第143条（民事法律行为有效条件），避免存在欺诈、胁迫等情形。

2. 单方申请法院强制执行以资抵债
   若债务人未履行生效判决（如工程款支付义务），债权人可申请法院强制执行债务人财产。此时：

   • 拍卖优先原则：法院通常先通过拍卖、变卖财产清偿债务（《民事诉讼法》第254条）。若拍卖价低于工程款，债权人仍需接受拍卖结果，不足部分可继续向债务人追偿；
     
   • 以资抵债的例外：若拍卖流拍（如无人竞买），且债权人同意以最后一次拍卖保留价接受财产抵债，法院可裁定“以物抵债”（《最高人民法院关于人民法院民事执行中拍卖、变卖财产的规定》第16条）。此时即使工程款高于抵债资产价值，债权人仍需接受，但可就差额部分申请保留债权。

3. 债务人破产情形下的处理
   若债务人进入破产程序，工程款债权需按《企业破产法》规定的清偿顺序受偿：

   • 破产财产优先清偿破产费用和共益债务后，依次清偿职工工资、税款、普通债权；
     
   • 若抵债资产属于破产财产，债权人需申报债权并参与分配，无法单独主张“以资抵债”；
     
   • 若工程款享有建设工程价款优先受偿权（《民法典》第807条），债权人可就该工程折价或拍卖价款优先受偿，但优先权范围仅限于“承包人因承包工程实际支出的费用”，不包括利润。

建议行动步骤：

1. 核查合同与证据：整理工程合同、结算文件、催款记录等，证明工程款金额及债务人违约事实；
   
2. 评估抵债资产：委托专业机构对拟抵债资产进行价值评估，明确其市场价值及权属状态；
   
3. 协商或诉讼选择：
   
   • 若债务人配合，优先通过协商签订《以资抵债协议》，并办理资产过户手续；
     
   • 若债务人拒不履行，及时申请法院强制执行或参与破产程序，主张优先受偿权；
     
4. 风险防范：注意抵债资产是否存在抵押、查封等权利限制，避免因资产瑕疵导致无法过户或再次被执行。

如有进一步疑问或需具体方案，可直接向我咨询。