您好，针对您提出的“专业监理证书被公司扣了怎么办”这一问题，我会从法律、流程以及实际操作的角度为您详细解答。

首先，需要明确的是，专业监理证书是您个人通过考试或评审获得的职业资格证书，其所有权和使用权均归您个人所有，公司无权扣留。如果公司扣留了您的证书，这可能涉及到违法行为，您有权采取法律手段来维护自己的权益。

针对此情况，您可以采取以下步骤：

1. 与公司沟通：

   • 首先，尝试与公司进行友好沟通，了解公司扣留证书的具体原因。
   • 明确告知公司，证书是您的个人财产，公司无权扣留，并要求公司立即归还。

2. 收集证据：

   • 如果公司拒绝归还，您需要开始收集相关证据，如工作合同、证书复印件、与公司沟通的记录等。
   • 这些证据将在后续的法律程序中起到关键作用。

3. 向相关部门投诉：

   • 您可以向当地的住房和城乡建设部门或劳动监察部门投诉公司的违法行为。
   • 投诉时，提供您收集的证据，并详细说明情况。

4. 考虑法律途径：

   • 如果投诉无果，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。
   • 可以咨询律师，了解具体的法律程序和可能的结果。
   • 根据律师的建议，向法院提起诉讼，要求公司归还证书并可能要求赔偿。

5. 关注证书状态：

   • 在处理此问题的过程中，您还需要关注自己的证书状态。
   • 如果证书被公司用于非法目的（如挂靠、出借等），您可能需要及时向相关部门报告，并申请注销或重新办理证书。

另外，关于您提供的参考信息：

• 参考信息中的“建督撤字”文件是关于撤销监理工程师注册的决定，这与您当前的问题（证书被扣留）不完全相关。但这些文件说明了监理工程师注册的重要性和严肃性，以及违规行为的法律后果。
• 如果您的证书被扣留是因为公司涉嫌违规使用（如挂靠），那么您需要更加警惕，并及时采取措施防止自己的证书被滥用。

最后，我建议您：

• 保持冷静，不要与公司发生直接冲突。
• 及时收集证据，为后续的法律程序做好准备。
• 咨询专业律师或相关部门的意见，确保自己的权益得到最大程度的保护。

希望以上解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。