工伤做了两次鉴定，单位不服的情况下，二次鉴定结论是有可能被推翻的，但整体推翻的几率并不高，通常在10%-30%左右，具体几率受多种因素影响。以下是对此问题的详细分析：
一、影响二次鉴定推翻初次鉴定结论的因素
初次鉴定的准确性和合规性：
- 如果初次鉴定程序合法、依据充分、结论准确，那么二次鉴定推翻其结论的可能性就相对较小。
- 反之，如果初次鉴定存在程序违法、依据不足或结论明显错误等问题，二次鉴定推翻其结论的可能性就会增加。例如，初次鉴定时未充分考虑工伤职工的完整医疗记录，或者鉴定人员不具备相应资质等。
新证据的出现：
- 在二次鉴定过程中，如果能够提供新的、更有力的证据来支持自己的主张，那么推翻初次鉴定结论的可能性就会增大。
- 例如，更详细的医疗记录、更专业的医学诊断报告，或者能够证明初次鉴定时未考虑到的关键事实等。
鉴定机构的权威性和专业性：
- 不同的鉴定机构在权威性和专业性上可能存在差异。一般来说，省级劳动能力鉴定委员会作出的鉴定结论权威性更高，更难被推翻。
- 而市级劳动能力鉴定委员会的鉴定结论，如果存在明显问题，可能更容易在二次鉴定中被推翻。
法律法规和政策的变化：
- 工伤保险相关的法律法规和政策可能会随着时间的推移而发生变化。如果二次鉴定时适用的法律法规或政策与初次鉴定时不同，也可能导致鉴定结论的差异。
个人情况和伤情变化：
- 工伤职工的伤情可能会随着时间的推移而发生变化。如果二次鉴定时伤情已经稳定或有所好转/恶化，也可能影响鉴定结论。
二、二次鉴定推翻初次鉴定结论的常见情况
初次鉴定程序不合法：
- 如鉴定人员不具备相应资质、鉴定过程未遵循法定程序等。这种情况下，二次鉴定机构可能会以程序违法为由推翻初次鉴定结论。
初次鉴定依据不充分：
- 如医疗记录不完整、诊断不明确等。如果初次鉴定时未能充分收集和分析相关证据，导致结论缺乏依据，二次鉴定时可能会根据更充分的证据作出不同结论。
初次鉴定结论明显错误：
- 如将非工伤认定为工伤、将低等级伤残认定为高等级伤残等。这种情况下，二次鉴定机构在核实相关事实后，很可能会推翻初次鉴定结论。
三、法律建议
对于单位而言：
- 如果对初次鉴定结论不服，应在规定期限内及时申请二次鉴定，并充分准备相关证据和材料。
- 在申请二次鉴定时，应仔细分析初次鉴定结论可能存在的问题，并针对性地提出异议和证据。
对于工伤职工而言：
- 如果单位申请了二次鉴定，应积极配合并提供必要的协助和证据。
- 同时，工伤职工也可以自行收集相关证据和材料，以支持自己的主张和权益。
双方共同注意事项：
- 在整个鉴定过程中，双方都应保持冷静和理性，避免情绪化行为影响鉴定结果。
- 如果对鉴定结论仍有异议，可以考虑通过法律途径解决争议，如申请行政复议或提起行政诉讼等。
最后需要强调的是，工伤鉴定是一个复杂而严谨的过程，涉及多个环节和因素。因此，在面对工伤鉴定问题时，建议双方都保持谨慎和重视的态度，并寻求专业律师的帮助和指导。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。