针对您提出的问题，即未参加工伤保险且经营地和发生事故地不在一个地区时，应向哪里申请工伤认定，以下是我的详细解答：
首先，我们需要明确的是，当用人单位的注册地与生产经营地不一致时，工伤认定的申请地点是有明确规定的。根据《人力资源社会保障部关于执行<工伤保险条例>若干问题的意见(二)》的相关规定，如果用人单位未在注册地参加工伤保险，那么职工在受到事故伤害或患职业病后，应当在生产经营地进行工伤认定。
生产经营地的理解是关键。它不仅仅指用人单位的注册地址或主要办公地点，而是更广泛地包括用人单位开展日常运营、管理以及提供服务的主要场所。对于船舶航运公司等特殊行业，生产经营地还应包括船舶停靠的港口、办公场所所在地，以及进行业务活动如货物运输、船舶维护、船员管理等职工实际从事工作的地点。
以您提到的案例为例，吴某在船舶停泊在宜昌市猇亭云池港口等待卸货过程中发生工伤事故。虽然航运公司的注册地在河南固始，但吴某实际提供劳动的场所是宜昌市，因此宜昌市可以视为其生产经营地。在这种情况下，吴某向宜昌市人力资源和社会保障局申请工伤认定是符合规定的。
此外，如果职工在多个地点都有工作场所，或者生产经营地难以确定，那么可以根据实际情况，选择最有利于职工权益保护的地点进行工伤认定。这通常意味着选择职工实际受伤地点或最常工作地点的相关行政部门进行申请。
总结来说：
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。