针对您提出的“受伤地和公司地不在一个市，申请工伤认定在哪个市申请”的问题，以下是我的详细解答：

首先，我们需要明确几个关键概念：用人单位注册地、生产经营地以及工伤认定申请受理管辖。

1. 用人单位注册地：即公司依法登记注册的地址，是公司的法定住所。

2. 生产经营地：指用人单位具体生产、经营、办公所在地。对于存在相对固定工作场所的从业人员，该工作场所可视为生产经营地。在航运、建筑等行业中，生产经营地可能包括船舶停靠的港口、办公场所所在地，以及进行业务活动如货物运输、船舶维护、项目管理等职工实际从事工作的地点。

3. 工伤认定申请受理管辖：即哪个地区的人力资源和社会保障局有权受理工伤认定申请。

接下来，我们根据不同情况来解答您的问题：

• 如果用人单位在注册地与生产经营地均已为劳动者参加工伤保险： 在这种情况下，工伤认定申请通常应在参保地进行。因为参保地的人力资源和社会保障局已经掌握了您的工伤保险信息，便于进行工伤认定和后续赔付。

• 如果用人单位在注册地与生产经营地均未为劳动者参加工伤保险，且用人单位生产经营地在本市行政区域内： 根据相关规定，您应向生产经营地所在区的人力资源和社会保障局申请工伤认定。这是因为生产经营地是您实际从事工作的地点，也是工伤事故发生地，由该地的人力资源和社会保障局进行工伤认定更符合实际情况。

• 针对您提出的具体情况（受伤地和公司地不在一个市）： 如果用人单位未为您参加工伤保险，且您的受伤地点（即实际提供劳动的场所）可以视为用人单位的生产经营地，那么您应向该生产经营地所在市的人力资源和社会保障局申请工伤认定。例如，在您提到的航运公司案例中，虽然公司注册地在河南固始，但吴某在宜昌市猇亭云池港受伤，且该港口可以视为航运公司的生产经营地之一，因此吴某向宜昌市人社局申请工伤认定是符合规定的。

• 特殊情况处理： 如果用人单位的生产经营地涉及本市两个及以上行政区，且区人力资源和社会保障局对受理管辖有争议，那么它们应当协商处理；协商不成的，可报请市人力资源社会保障局指定管辖。

综上所述，针对您提出的问题，如果用人单位未为您参加工伤保险，且您的受伤地点可以视为用人单位的生产经营地，那么您应向该生产经营地所在市的人力资源和社会保障局申请工伤认定。这样既能确保您的合法权益得到及时保护，也符合国家设立工伤保险制度的目的。