结论：对证人持有的手机进行扣押并非绝对不可，但必须满足一定条件并严格遵循法律程序。以下是对此问题的详细分析：

一、扣押的合法性及条件

根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，侦查机关（如公安机关、人民检察院）在侦查犯罪过程中，如果证人持有的手机中包含与案件有关的信息，且这些信息能够作为证据使用，证明犯罪嫌疑人有罪或者无罪，那么侦查机关有权对该手机进行扣押。但这一行为必须基于足够的证据表明手机与案件存在实质性关联，否则不得随意扣押，以保障证人的合法权益，避免对其正常生活和工作造成不必要的干扰。

二、扣押的法律程序

在扣押证人持有的手机时，侦查机关必须遵循严格的法律程序：

1. 出示证件和手续：侦查人员在进行扣押前，必须向证人出示工作证件和相应的法律文书，如搜查证、扣押决定书等，以表明执法的合法性和正当性。
2. 制作扣押清单：当场开列清单一式二份，详细记录被扣押手机的名称、型号、数量等信息，由侦查人员、见证人和证人签名或盖章。一份交给证人，另一份附卷备查，确保扣押物品的来源和去向清晰可查。
3. 妥善保管与处理：对扣押的手机应妥善保管，不得挪作他用。对不宜长期保存的物品，应按照有关规定处理。同时，应尽快查明手机与案件的关系，及时完成相关的调查取证工作。

三、证人权利保障

在扣押过程中，必须充分保障证人的合法权利：

1. 告知义务：证人应被告知扣押的理由和依据，以及其对扣押提出异议的权利。
2. 申请退还：证人应被告知如何申请退还扣押的手机。一旦确认手机中的信息与案件无关，或者已经完成了相关的调查取证工作，侦查机关应立即将手机返还给证人。

四、扣押期限与后续处理

虽然法律没有明确规定扣押证人手机的具体时间限制，但侦查机关在扣押后应尽快查明手机与案件的关系。如果手机中包含重要证据，需要进一步分析或鉴定，也应在法定时限内完成相关工作，并及时将手机返还给证人。同时，扣押的手机及其中的信息应严格按照证据使用的规定进行处理，确保其合法性和有效性。在案件侦查终结后，如果手机不再作为证据使用，或者已经完成了其作为证据的使命，侦查机关也应及时将手机返还给证人。

法律建议：如果您作为证人遇到了手机被扣押的情况，首先应当配合侦查机关的工作，同时了解扣押的理由和依据。如果您认为扣押行为不合法或者侵犯了您的合法权益，您可以及时提出异议并申请退还。如果您在扣押过程中遇到了任何问题或者需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。