关于检察院扣押证人手机的情况，其处理方式及法律依据可以为您详细解释如下：
首先，手机被扣押后的处理主要取决于手机与案件的关联性。这一原则确保了司法程序的公正性和合理性。
手机与案件的关联性及处理
若手机与案件有关：
- 作为证据：如果手机中的数据、通信记录或其他信息能够直接关联到案件事实，证明犯罪嫌疑人的犯罪行为或其他关键要素，那么该手机将被视为重要物证。检察院会仔细审查手机中的证据，确保其真实性、合法性和与案件的关联性，以便在后续的法庭审判中作为呈堂证供。
- 作为犯罪工具：如果手机被用于实施犯罪，如组织非法活动、进行电信诈骗等，那么在案件判决生效后，手机可能会被依法没收，并上缴国库。这一决定通常由法院在判决书中明确作出，并由相关执行机关执行。
若手机与案件无关：
- 在这种情况下，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，检察院或公安机关应当在确认手机与案件无关联后的三日内解除扣押，并通知手机所有人前来办理退还手续。退还时，办案人员会核实手机所有人的身份信息，确保手机归还给正确的当事人。
当事人的权利与义务
- 知情权：当事人有权了解案件的进展情况，包括手机等个人财物的处理情况。这有助于确保当事人的合法权益不受侵害。
- 配合义务：在案件调查过程中，当事人应当积极配合公安机关、检察院和法院的调查工作，如实提供相关信息和证据。这有助于案件的高效、准确处理。
- 维权途径：如果当事人认为自己的合法权益受到侵害，如手机被错误扣押或未按时退还，可以通过法律途径进行申诉或寻求法律援助。这确保了当事人的合法权益得到有效保障。
综上所述，检察院扣押证人手机后的处理方式严格遵循法律规定，并根据手机与案件的关联性进行相应处理。当事人在整个过程中应了解自己的权利和义务，积极配合调查工作，并关注案件进展及手机等财物的处理情况。如有任何疑问或认为自身权益受到侵害，应及时通过法律途径进行维权。