针对您提出的“自然人出租房屋不开发票违法怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，自然人出租房屋时，如果承租方要求开具发票，出租方是有义务提供发票的。不开发票可能构成违法行为，因为这可能涉及到偷逃税款的问题。

一、违法行为的处理

1. 税务机关查处：如果税务机关发现自然人出租房屋未开具发票，可能会进行税务稽查，并要求出租方补缴税款、滞纳金，甚至可能面临罚款。

2. 法律责任：根据相关法律法规，偷逃税款是违法行为，出租方可能需要承担相应的法律责任，包括但不限于行政处罚和刑事处罚（在情节严重的情况下）。

二、如何合法开具发票

为了避免违法行为，自然人出租房屋时应该按照以下步骤合法开具发票：

1. 了解申请条件：

   • 自然人出租其不动产，承租方不属于自然人的，纳税人缴纳增值税后可以向税务机关申请代开增值税普通发票及专用发票。
   • 如果承租方是自然人，则不得开具或申请代开增值税专用发票。

2. 准备办理资料：

   • 首次办理房屋租赁业务的纳税人需提交《代开增值税发票缴纳税款申报单》、经办人身份证明（验原件留复印件，经办人非业主本人的还需提供业主授权委托书）。
   • 不动产权属资料及其复印件、出租不动产的合同、协议或者税务机关认可的其他资料及其复印件。

3. 选择办理渠道：

   • 可以通过电子税务局APP、办税服务大厅或街道租赁办（在特定地区如罗湖、福田、南山、前海、龙华等）申请代开发票。
   • 如果需要增值税专用发票，可通过@深税、电子税务局APP或办税服务厅申请代开。

4. 遵循办理流程：

   • 按照税务机关或街道租赁办的要求填写申报单、提交资料，并缴纳相应的税款。
   • 税务机关或街道租赁办审核通过后，会代开发票并交给纳税人。

三、注意事项

1. 确保资料真实合法：纳税人对报送材料的真实性和合法性承担责任，因此务必确保提供的资料真实、准确、完整。

2. 及时办理：在承租方要求开具发票时，出租方应及时办理代开发票手续，避免拖延导致违法行为。

3. 了解税收政策：自然人出租房屋可能涉及增值税、个人所得税等税种，出租方应了解相关税收政策，确保合规纳税。

综上所述，自然人出租房屋不开发票是违法行为，可能面临税务机关的查处和法律责任。为了避免这种情况的发生，出租方应该按照上述步骤合法开具发票，并确保资料的真实性和合法性。如有任何疑问或需要进一步的帮助，请咨询当地税务机关或专业税务顾问。