关于指定监护人的案件管辖问题，这主要涉及到对监护人确定存在争议时的处理流程。根据《中华人民共和国民法典》第三十一条的相关规定，我可以为您详细解答如下：

首先，当对监护人的确定存在争议时，被监护人住所地的居民委员会、村民委员会或者民政部门是有权进行初步指定的机构。这些机构会根据被监护人的实际情况，以及依法具有监护资格的人的情况，按照最有利于被监护人的原则来指定监护人。

然而，如果有关当事人对上述机构指定的监护人不服，那么他们有权向人民法院提出申请，请求人民法院进行指定。此外，有关当事人也可以直接向人民法院提出申请，由人民法院来指定监护人。这意味着，在存在争议的情况下，人民法院是最终的指定机构，其裁判具有法律效力。

在指定监护人的过程中，无论是居民委员会、村民委员会、民政部门还是人民法院，都应当尊重被监护人的真实意愿，并确保指定的监护人能够最有利于被监护人的利益。

另外，如果在指定监护人之前，被监护人的人身权利、财产权利以及其他合法权益处于无人保护状态，那么由被监护人住所地的居民委员会、村民委员会、法律规定的有关组织或者民政部门担任临时监护人，以确保被监护人的权益不受侵害。

最后，需要强调的是，一旦监护人被指定，任何人都不得擅自变更。如果擅自变更监护人，不仅变更行为可能无效，而且并不免除被指定的监护人的监护责任。被指定的监护人仍须承担监护责任，确保被监护人的权益得到妥善保护。

综上所述，指定监护人的案件在存在争议时，最终由人民法院进行管辖和指定。希望这个解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时告诉我。