当绩效考核改革中有一个员工不同意时，可以从员工和企业管理者两个角度来处理这一问题：
员工方面
了解并评估绩效考核制度：
- 员工应首先详细阅读并理解公司新的绩效考核制度，明确自己不认同的具体条款或评估标准。
- 收集过往工作数据、行业平均水平等证据，以支持自己的观点，评估新制度对自己工作评价和薪酬的可能影响。
积极沟通与协商：
- 选择合适的时机，以平和的态度与上级领导进行一对一沟通，清晰阐述自己对新绩效考核制度的看法和疑问。
- 如果与直接上级沟通无果，可以考虑向上级的上级反映情况，但应确保已充分尝试与直接上级沟通，并尊重组织层级。
- 在沟通过程中，保持冷静，认真倾听对方的想法和理由，尝试寻求双方都能接受的解决方案。
正式申诉与反馈：
- 如果内部沟通未能解决问题，员工可以查阅公司相关制度，按照规定的流程，以书面形式提交申诉材料。申诉材料应包括自己对新绩效考核制度的看法、不认同的原因、相关证据以及期望的解决方案等。
- 等待并关注申诉的处理结果，确保自己的权益得到公正对待。如果申诉被驳回或处理结果不满意，可以考虑进一步采取法律途径。
考虑法律途径：
- 若公司内部解决途径无效，且员工认为新绩效考核制度违反了相关法律法规或劳动合同约定，员工可以考虑寻求法律援助或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，员工有权就劳动争议申请调解或仲裁，以维护自己的合法权益。
企业管理者方面
开放与透明的沟通：
- 管理者应展现出开放的态度，积极倾听员工对新绩效考核制度的异议和想法。
- 营造一个宽松的沟通氛围，避免急于反驳或压制员工的意见，给予员工充分的时间阐述观点。
审视与调整绩效考核方案：
- 根据员工反馈，全面、深入地审查新的绩效考核方案，分析员工提出的异议是否合理。
- 结合企业战略、市场环境以及员工实际工作情况等多方面因素，综合评估绩效考核方案的科学性和可行性。
- 如果发现绩效考核方案确实存在不合理之处，应及时进行修订和完善，确保方案的公平性和合理性。
培训与辅导：
- 如果员工对新的绩效考核方案存在误解或不了解，管理者应及时安排针对性的培训和辅导。
- 通过案例分析、实际操作演练等方式，帮助员工理解新的绩效考核方案与企业目标及个人发展的关系，提高员工对方案的认可度和执行能力。
记录与及时反馈：
- 对员工提出的绩效考核异议及处理过程进行详细记录，包括问题、沟通时间、方式及解决措施等信息。
- 及时将绩效考核方案的调整结果和处理意见反馈给员工，确保他们了解最终决定，并对处理结果满意。这有助于增强员工对企业的信任感和归属感。
总结来说，面对员工对绩效考核改革不同意的情况，双方都应保持冷静与理性，通过合理合法的途径来解决问题。员工应积极沟通、申诉，并在必要时寻求法律途径；企业管理者则应展现开放态度，及时调整绩效考核方案，确保公平公正。如果双方能够坦诚沟通、相互理解并寻求共赢的解决方案，那么这一问题往往能够得到妥善解决。