在施工单位违法转包造成工程事故的情况下，追究刑事责任应主要针对施工单位，但若转包的实际施工人存在重大过错或故意行为，也可能被追究刑事责任。以下从不同角度进行详细分析：
一、施工单位作为违法转包主体的刑事责任
违法转包行为的定性：
- 根据《中华人民共和国建筑法》及相关法规，施工单位不得将其承包的全部工程转包给他人，也不得将工程肢解后以分包的名义分别转包给他人。违法转包行为本身即构成违法，若因此导致工程事故，施工单位需承担相应的法律责任。
刑事责任追究：
- 若工程事故造成严重后果，如人员伤亡或重大财产损失，施工单位可能因违反安全生产管理规定或构成重大责任事故罪等被追究刑事责任。此时，施工单位作为违法转包的主体，其违法行为与事故后果之间存在直接因果关系，因此应成为刑事责任追究的主要对象。
二、转包的实际施工人的刑事责任
实际施工人的角色与责任：
- 转包的实际施工人虽然与发包人没有直接的合同关系，但其实际承担了工程的施工任务。若实际施工人在施工过程中存在违法行为或重大过错，如违反安全生产规定、使用不合格材料等，导致工程事故发生，其也可能被追究刑事责任。
刑事责任的具体情形：
- 若实际施工人的行为构成犯罪，如重大责任事故罪、工程重大安全事故罪等，且其违法行为与事故后果之间存在直接因果关系，那么实际施工人也将被追究刑事责任。此时，实际施工人的刑事责任并不免除施工单位的刑事责任，两者可能同时被追究。
三、刑事责任追究的考量因素
过错程度：
- 在追究刑事责任时，需考虑施工单位和实际施工人的过错程度。若施工单位仅存在违法转包行为，而实际施工人在施工过程中存在重大过错或故意行为导致事故发生，那么实际施工人的刑事责任可能更重。
因果关系：
- 刑事责任追究还需考虑违法行为与事故后果之间的因果关系。若施工单位的违法转包行为与事故后果之间存在直接因果关系，而实际施工人的行为对事故后果的影响较小或没有影响，那么施工单位的刑事责任将更重。
四、法律建议
对于施工单位：
- 应严格遵守相关法律法规，不得违法转包工程。若需分包工程，应依法选择具有相应资质的分包单位，并签订书面分包合同，明确双方的权利和义务。
对于实际施工人：
- 在承接工程时，应确保自身具备相应的施工资质和安全生产条件。在施工过程中，应严格遵守安全生产规定和操作规程，确保工程质量安全。
在事故发生后：
- 施工单位和实际施工人应积极配合相关部门的调查工作，如实提供有关情况和证据。若存在违法行为或过错行为，应主动承担相应的法律责任，并积极采取措施进行整改和补救。
综上所述，在施工单位违法转包造成工程事故的情况下，追究刑事责任应主要针对施工单位，但若转包的实际施工人存在重大过错或故意行为，也可能被追究刑事责任。具体责任划分需根据过错程度、因果关系等因素进行综合考量。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。