针对您提出的“工程违法转包到实际施工人造成工程质量问题如何处理”的问题，这是一个涉及法律、行政监管、民事责任以及后续整改等多个层面的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、法律层面的处罚
责令改正与没收违法所得：
- 根据《中华人民共和国建筑法》第六十七条和《建设工程质量管理条例》第六十二条，违法转包行为将由建设行政主管部门责令改正，并没收因转包获取的非法所得。
罚款：
- 罚款标准依据违法所得金额或合同价款的比例进行。例如，对施工总承包单位可能处以工程合同价款0.5%以上1%以下的罚款。
降低资质等级或吊销资质证书：
- 对于情节严重的转包行为，企业可能面临降低资质等级或吊销资质证书的处罚，这将直接影响其市场竞争力。
追究刑事责任：
- 如果转包行为构成犯罪，如重大安全事故罪，将依法追究刑事责任，依据《中华人民共和国刑法》第一百三十七条等规定进行处罚。
二、行政监管措施
信用惩戒：
- 违法转包行为将被纳入建筑市场信用体系，记录不良行为信息，限制企业参与招投标活动，降低其市场信誉。
联合执法与行业通报：
- 多部门将联合查处违法转包行为，形成监管合力。同时，通过行业通报曝光典型案例，以警示其他市场主体。
三、民事与合同责任
合同无效处理：
- 转包合同因违反法律强制性规定而无效。根据《民法典》第一百五十三条，可以确认合同效力，并依法处理相关事宜。
赔偿损失：
- 因转包导致工程质量问题的，转包方需承担赔偿责任，包括修复费用、工期延误损失及第三方损害赔偿等。
四、具体处理流程与建议
立即停止违法行为：
- 一旦发现违法转包行为，应立即停止，并通知相关方，防止问题进一步恶化。
收集证据并举报：
- 收集违法转包的证据，如合同、转账记录、沟通记录等，并向建设行政主管部门或相关监察机关举报。
协商或诉讼解决纠纷：
- 尝试与转包方和实际施工人协商解决纠纷，明确责任归属和赔偿方案。如果协商无果，可以考虑通过仲裁或诉讼等法律途径解决。
要求整改与保障质量：
- 要求责任方对存在质量隐患的工程进行返工或加固，确保工程符合安全使用标准。同时，可以聘请专业机构进行质量评估，作为后续处理的依据。
完善管理制度与加强培训：
- 督促企业健全内部管理机制，防止类似问题再次发生。加强人员培训，提升法律意识与合规水平，确保企业运营符合法律法规要求。
五、预防与对策
严格选择施工单位：
- 在发包时，应优先选择具有相应资质和良好信誉的施工单位，确保工程质量和安全。
加强过程监管：
- 在施工过程中，应加强对施工单位的监管，定期检查工程进度和质量，及时发现并纠正问题。
增强法律意识：
- 建设单位和施工单位应充分了解违法分包和转包的法律后果，自觉遵守相关法律法规，增强法制观念。
综上所述，处理工程违法转包到实际施工人造成的工程质量问题需要综合运用法律、行政监管、民事责任以及后续整改等多种手段。希望以上解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。