核心结论：乙方承租甲方宅基地用于建厂房，这一行为涉及宅基地用途变更、租赁合同效力、建设合法性等多方面法律问题，需谨慎处理，具体如下：

1. 宅基地用途限制与变更问题

   • 宅基地是农村村民用于建造住宅及其附属设施的集体建设用地，其用途具有特定性，一般不允许擅自改变用途用于建厂房等非住宅用途。
   • 若乙方要在承租的宅基地上建厂房，首先需面临宅基地用途变更的问题。这通常需要经过相关部门的审批，如国土资源部门、城乡规划部门等，办理土地用途变更手续，将宅基地变更为工业用地或其他允许建设厂房的用地类型。未经审批擅自改变用途，可能面临行政处罚，包括责令限期改正、罚款等，甚至可能导致已建厂房被拆除。

2. 租赁合同效力问题

   • 由于宅基地用途的特殊性，租赁合同中关于乙方在宅基地上建厂房的条款可能因违反法律、行政法规的强制性规定而无效。根据《民法典》相关规定，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效，但是该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外。
   • 如果租赁合同部分无效，不影响其他部分效力的，其他部分仍然有效。但关于建厂房的条款无效，可能导致乙方无法按照原计划在宅基地上建设厂房，进而影响其经营计划和投资回报。同时，甲方也可能因出租宅基地用于非法定用途而承担一定的法律责任。

3. 建设合法性问题

   • 即使办理了宅基地用途变更手续，乙方在建设厂房时还需遵守相关建设法律法规，办理建设工程规划许可证等审批手续。未经规划审批擅自建设厂房，属于违法建设行为，可能面临责令停止建设、限期拆除、罚款等行政处罚。
   • 此外，厂房建设还需符合消防、环保、安全等方面的要求，办理相应的验收手续。否则，厂房可能无法投入使用，甚至可能因存在安全隐患而被责令整改或关闭。

4. 建议与应对措施

   • 对于乙方：在承租宅基地前，应充分了解宅基地的用途限制和相关法律法规，谨慎评估在宅基地上建厂房的可行性和风险。如决定承租并建设厂房，应积极与甲方沟通，共同办理土地用途变更和建设审批手续，确保建设行为的合法性。同时，在租赁合同中明确双方的权利义务和违约责任，以降低法律风险。
   • 对于甲方：应如实告知乙方宅基地的用途限制和相关情况，不得隐瞒或误导乙方。在出租宅基地时，应要求乙方承诺合法使用土地，不得擅自改变用途或进行违法建设。如乙方违反约定，甲方应及时制止并要求其整改，必要时可解除租赁合同并追究其违约责任。