在“甲方出钱建厂房、乙方出地”这种合作模式下，双方的权利义务及利益分配通常需要通过协商以合同形式确定，以下从不同角度为你分析常见的处理方式及要点：

1. 合作模式选择及利益分配

   • 联营合作：双方可以签订联营合同，约定按照一定比例共同经营、共享收益、共担风险。例如，甲方负责出资建设厂房及后续生产经营所需的资金，乙方提供土地使用权，双方按照出资比例（这里乙方的出资可折算为土地价值）或者其他协商确定的比例分配利润、分担亏损。在联营期间，厂房的所有权和使用权归属以及联营期限等都需要明确约定。
   • 租赁合作：乙方将土地出租给甲方，甲方在土地上出资建设厂房并进行生产经营。此时，乙方收取土地租金，甲方拥有厂房的所有权（但要注意土地性质，如果是划拨土地等特殊情况可能影响厂房产权的合法性及处置）以及一定期限内对土地的使用权。租赁期限、租金支付方式、厂房建设标准以及租赁期满后厂房的归属等问题都应在合同中详细规定。
   • 合作开发：若双方有共同开发项目的意图，可签订合作开发合同。这种情况下，双方按照约定共同投入资源（甲方资金、乙方土地），共同参与项目的规划、建设、运营等环节，并按照约定分配开发成果（如建成后的厂房及相关产业收益）。同样，各方的权利义务、投入方式、收益分配比例、风险承担等关键条款必须明确。

2. 法律风险防范及合同要点

   • 土地性质与用途：必须确保乙方提供的土地性质符合建设厂房的要求。例如，如果是农用地，需要依法办理农用地转用审批手续；如果是集体建设用地，要符合相关规划和用途管制规定。否则，厂房可能面临被认定为违法建筑而遭受拆除、罚款等风险。在合同中应明确乙方对土地性质和用途合法性的保证责任，以及因土地问题导致甲方损失的赔偿责任。
   • 产权归属与登记：明确厂房建成后的产权归属。如果约定归甲方所有，应及时办理产权登记手续，此时可能需要乙方协助提供相关土地证明文件等；如果归双方共有，要约定共有的方式（按份共有或共同共有）以及各自份额，并办理相应的产权登记。同时，在合同中应规定因产权登记产生的费用承担方式。
   • 合同期限与终止：根据不同的合作模式，合理确定合同期限。在联营或合作开发合同中，要考虑项目的运营周期和市场情况；在租赁合同中，要遵守法律规定的租赁期限上限（一般不超过二十年）。合同终止时，厂房的处置方式（如拆除、折价归一方所有等）、土地的返还等事项都应明确约定，以避免纠纷。
   • 违约责任：详细约定双方的违约责任，包括但不限于未按时出资、未按照约定提供土地或建设厂房、擅自改变土地用途或厂房结构等违约行为的认定及相应的赔偿责任。违约责任的约定要具体、明确，具有可操作性，以便在发生纠纷时能够依法维护自身权益。

总之，在这种合作模式下，双方应充分协商，明确各自的权利义务，并通过签订详细、完善的合同来保障合作的顺利进行。如果你有具体的合作细节或遇到相关法律问题，欢迎随时向我咨询。