子公司向总公司支付人员工资，这一行为本身并不直接违法，但需要满足一定的条件和程序。以下从不同角度为你详细分析：
一、合法性分析
内部财务安排：子公司和总公司作为独立的法人实体，它们之间的财务往来，包括工资支付，可以视为一种内部财务安排。只要这种安排符合相关法律法规和公司章程的规定，且没有损害员工、股东或债权人的利益，就是合法的。
劳动合同关系：关键在于员工是与子公司还是总公司签订的劳动合同。如果员工是与子公司签订的劳动合同，那么子公司有义务直接向员工支付工资。如果子公司因某种原因（如财务集中管理）需要通过总公司支付工资，这应当基于子公司与总公司之间的合法协议，并且确保工资能够及时、足额地支付给员工。
税务和社保合规：无论工资由谁支付，都必须确保税务和社保的合规性。子公司或总公司作为支付方，需要按照相关法律法规的规定，代扣代缴员工的个人所得税，并按时足额缴纳社会保险费。
二、潜在风险与注意事项
劳动合同主体不一致风险：如果员工是与子公司签订的劳动合同，但工资由总公司支付，且没有明确的协议或说明，可能会引发劳动合同主体不一致的争议。这可能导致员工在维权时面临困难，也可能给公司带来法律风险。
工资支付延迟或不足风险：如果子公司依赖总公司支付工资，而总公司因各种原因（如资金链紧张）导致工资支付延迟或不足，这将直接影响员工的切身利益，也可能引发劳动纠纷。
税务和社保合规风险：如前所述，无论工资由谁支付，都必须确保税务和社保的合规性。如果在这方面存在疏忽或违规行为，可能会面临税务部门的处罚和社保部门的追缴。
三、建议与措施
明确劳动合同关系：确保员工与正确的法人实体签订劳动合同，并在合同中明确工资支付方式和责任主体。
建立合法协议：如果子公司需要通过总公司支付工资，应当建立合法的协议或说明，明确双方的权利和义务，以及工资支付的具体方式和时间。
加强内部管理：子公司和总公司应当加强内部管理，确保工资支付的及时性和足额性，以及税务和社保的合规性。
及时沟通与解释：如果因特殊原因需要变更工资支付方式或主体，应当及时与员工进行沟通和解释，确保员工的理解和同意。
总结来说，子公司向总公司支付人员工资本身并不违法，但需要满足一定的条件和程序。为了确保合法性和避免潜在风险，建议你根据公司的实际情况，咨询专业法律人士或财务顾问，制定合适的工资支付方案和管理制度。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。