一般而言，子公司员工的工资由母公司发放并不必然违法，但必须符合相关法律规定和财务规范。下面我为您详细解析：

1. 子公司的独立法人地位：

   • 子公司作为独立法人，享有独立的财务和运营自主权。这意味着，子公司应当自行承担其员工的工资发放责任。

2. 母公司代发工资的合法性：

   • 若母公司为子公司代发工资，必须基于合法的依据，如双方签署的委托协议或明确的财务规划。
   • 此种支付方式需严格遵守相关财务及税务规定，确保资金流动的合法性和透明性。

3. 潜在的法律风险：

   • 若无合法依据，母公司代发工资可能引发财务核算紊乱，损害子公司的独立人格，甚至可能牵涉逃税等法律风险。
   • 因此，在实际操作中，应谨慎处理母公司与子公司之间的资金往来，确保每笔交易都有明确的法律依据和财务记录。

4. 建议与措施：

   • 若确需母公司代发工资，建议母公司与子公司之间签订明确的委托协议，明确双方的权利和义务。
   • 同时，应确保代发工资的操作符合相关财务和税务规定，避免引发不必要的法律风险。

综上所述，母公司为子公司代发工资并不必然违法，但必须具备合法的依据和严格的财务规范。在实际操作中，应谨慎处理并确保每笔交易的合法性和透明性。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。