结论：医疗期期间，若员工因缺假条公司不给发工资，这一做法是否合法需分情况讨论。一般来说，如果员工确实处于医疗期且因合理原因无法提供假条，公司不应以此为由拒发工资；但如果员工无正当理由缺假条，公司可能依据规章制度暂停工资发放，但需谨慎处理并确保符合法律规定。

详细分析：

1. 医疗期的法律性质：

   • 医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限。在此期间，员工享有病假工资或疾病救济费，这是员工的合法权益。

2. 假条的作用与要求：

   • 假条通常是员工因病或非因工负伤需要休息时，由医疗机构出具的证明文件。它既是员工病情的证明，也是公司了解员工健康状况、安排工作的依据。
   • 公司要求员工提供假条作为请病假的依据，是合理的规章制度要求。但这一要求应合理、合法，且不得侵犯员工的合法权益。

3. 缺假条公司不给发工资的合法性分析：

   • 如果员工确实处于医疗期且因合理原因（如医疗机构未及时出具、遗失等）无法提供假条：公司不应以此为由拒发工资。员工可以事后补交假条或提供其他证明材料，公司应核实情况后补发工资。
   • 如果员工无正当理由缺假条：公司可能依据规章制度暂停工资发放。但在此情况下，公司应确保规章制度合法、合理，且已向员工明确告知。同时，公司应给予员工合理的解释和申诉机会，避免滥用权力侵犯员工权益。

4. 公司的应对措施与建议：

   • 完善规章制度：公司应制定明确的病假管理制度，包括假条的提交要求、工资发放规定等，并确保制度合法、合理。
   • 加强沟通与解释：当员工缺假条时，公司应主动与员工沟通，了解原因并给予合理的解释和指导。如果员工确实因合理原因无法提供假条，公司应灵活处理，确保员工权益不受损害。
   • 依法处理纠纷：如果因缺假条导致工资发放问题产生纠纷，公司应依法处理，避免采取过激或违法的行为。必要时，可以寻求法律援助或咨询专业律师。

5. 员工的权益保护：

   • 及时沟通：员工在医疗期期间应与公司保持沟通，及时提交假条或其他证明材料。如果因特殊原因无法按时提交，应提前向公司说明情况并寻求理解。
   • 了解权益：员工应了解自己的合法权益，包括医疗期的期限、病假工资的发放标准等。如果公司侵犯了自己的权益，可以依法维权。
   • 保留证据：员工应保留好与医疗期、病假工资相关的证据材料，如假条、医疗证明、工资条等，以便在需要时提供证明。

后续行动建议：

• 如果您作为员工遇到此类问题，建议首先与公司沟通解释缺假条的原因，并尽快补交假条或其他证明材料。如果公司仍拒发工资，您可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
• 如果您作为公司代表遇到此类问题，建议先核实员工缺假条的原因和情况，再依据公司规章制度和法律规定进行处理。如果处理过程中存在疑问或争议，可以咨询专业律师以确保合法合规。