结论：公司不能简单地忽略员工对合同条款的异议并等到期解除合同，这种做法可能涉及违法解除劳动合同的风险。
分析：
合同签订的基本原则：
- 合同的签订应当遵循自愿、平等、公平、诚实信用的原则。员工对合同条款提出异议，是其行使合同签订过程中的权利，公司应当予以重视并协商解决。
员工异议的处理：
- 当员工对合同条款提出异议时，公司应当与员工进行协商，就异议条款进行修改或解释，以达成双方都能接受的合同内容。如果公司忽略员工的异议，直接等到期解除合同，可能被视为未履行协商义务，违反了合同签订的基本原则。
违法解除劳动合同的风险：
- 如果公司未经协商，单方面以员工未签订合同为由解除劳动合同，可能构成违法解除。根据《劳动合同法》的相关规定，违法解除劳动合同的，公司需要支付赔偿金给员工。赔偿金的计算通常依据员工在公司的工作年限和工资水平来确定。
建议的处理方式：
- 公司应当积极与员工沟通，就异议条款进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。如果确实无法达成一致，公司可以考虑提供其他形式的补偿或调整工作安排，以避免直接解除劳动合同带来的法律风险。
法律后果：
- 如果公司忽略员工异议并等到期解除合同，员工有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付违法解除劳动合同的赔偿金。
- 仲裁委员会将根据双方提供的证据和法律规定，裁决公司是否需要支付赔偿金以及赔偿金的数额。
进一步思考：
- 公司在处理员工对合同条款的异议时，应当保持开放和包容的态度，积极寻求解决方案，以维护良好的劳动关系。
- 员工在提出异议时，也应当明确自己的诉求和理由，与公司进行充分的沟通和协商，以达成双方都能接受的合同内容。
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