派遣员工从事特殊工种但单位未备案，这一行为在多数情况下属于违法，但具体是否违法需依据相关法律法规和行业规定来判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、法律法规对特殊工种备案的要求
一般规定：
- 根据《关于加强提前退休工种审批工作的通知》等相关法律法规，企业对于特殊工种，必须按照规定将本单位特殊工种名称、从事人员名单及其变动情况，定期向当地劳动保障部门申报备案。这是用人单位应尽的法定义务，旨在保障特殊工种从业者的合法权益。
特定行业规定：
- 对于某些特定的特殊工种，如建筑施工特种作业人员等，相关法律法规可能进一步明确规定了备案管理的具体要求。单位若未按规定进行备案，将面临法律责任，包括行政处罚等。
二、单位未备案对劳动者权益的影响
提前退休受阻：
- 特殊工种从业者在满足一定工作年限等条件下，有权享受提前退休待遇。若单位未备案，社保部门难以核实员工从事特殊工种的情况，可能导致员工无法顺利办理提前退休手续，进而影响其养老待遇。
职业健康保障缺失：
- 特殊工种往往伴随一定的职业危害。国家要求对这类人员进行定期健康检查等保障措施。单位不备案可能导致员工无法得到应有的职业健康监护，增加职业病风险，且在遭受职业病伤害时维权困难。
三、单位可能承担的法律后果
行政处罚：
- 若单位未按规定进行特殊工种备案，劳动行政部门有权责令限期改正；逾期不改正的，可能对单位处以罚款等行政处罚。
民事赔偿责任：
- 因单位未备案导致员工无法享受提前退休待遇或遭受其他损失的，员工有权通过劳动仲裁或诉讼途径要求单位赔偿相应的经济损失。
四、劳动者的应对措施
了解报备规定：
- 员工应明确特殊工种报备的相关规定，包括报备流程、所需材料及时限等。这有助于后续与单位的沟通及向劳动行政部门的举报工作，确保自身诉求的合理性和合法性。
与单位沟通协商：
- 主动与单位人力资源部门或相关负责人沟通，了解未备案的具体原因，如是否为工作疏忽或资料不齐全等。明确提出补办特殊工种备案的要求，并提供工作经历、岗位证明等相关资料，协助单位完成备案手续。强调备案对于员工未来退休等权益的重要性。
向劳动行政部门举报：
- 若单位拒绝或拖延备案，员工可向当地劳动保障行政部门进行投诉举报。劳动行政部门有权对单位进行调查核实，并责令其按规定补办备案手续。
申请劳动仲裁：
- 若因单位未备案导致员工遭受实际损失，如无法享受提前退休待遇等，员工可考虑申请劳动仲裁，要求单位承担赔偿责任。在仲裁过程中，需充分展示相关证据以支持诉求。
总结与建议：
派遣员工从事特殊工种但单位未备案，这一行为可能违法并损害劳动者的合法权益。作为劳动者，应积极了解相关法律法规和报备规定，与单位进行沟通协商，并在必要时向劳动行政部门举报或申请劳动仲裁以维护自身权益。如果你在这一过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议和指导。