在工伤认定书出来后，应向设区的市级劳动能力鉴定委员会申请伤残鉴定。以下是详细解答：

一、申请机构的选择

根据相关法律法规及实践操作，工伤认定书生效后，申请伤残鉴定的机构是设区的市级劳动能力鉴定委员会。这一机构负责组织医疗卫生专家对工伤职工的劳动能力进行鉴定，并出具鉴定结论。

二、申请流程

1. 准备申请材料：

   • 申请表：下载或领取《劳动能力鉴定申请表》，并准确填写。
   • 工伤认定决定书：提供原件及复印件，以证明受伤性质属于工伤。
   • 身份证明：工伤职工本人的有效身份证明（如身份证、户口本）原件及复印件。若由近亲属代为申请，还需提供近亲属关系证明及其身份证明。
   • 医疗机构诊断证明材料：包括有效的诊断证明、检查报告、检验报告等完整病历材料。例如，脑部损伤需提供CT检查报告、脑电图报告等。
   • 其他相关材料：如治疗费用清单等，有助于全面评估伤情。

2. 提交申请并缴纳费用：

   • 将准备好的申请材料提交至劳动能力鉴定委员会办事窗口，工作人员会审核材料完整性。
   • 根据地区规定缴纳劳动能力鉴定费用，费用标准因地区而异，一般在几百元左右。具体费用可在申请时咨询。

3. 等待鉴定安排与参加鉴定：

   • 劳动能力鉴定委员会会从医疗卫生专家库中随机抽取专家组成专家组进行鉴定。一般会在收到申请之日起60日内作出鉴定结论，复杂情况可延长30日。期间可能会通知到指定医疗机构进行检查。
   • 按照通知的时间和地点前往参加伤残鉴定。需如实回答医生的问题，并提供必要的协助。

4. 接收鉴定结果及后续处理：

   • 劳动能力鉴定委员会会及时送达鉴定结论书，明确伤残等级和赔偿标准。
   • 若对鉴定结论不服，可在收到结论之日起15日内向省、自治区、直辖市劳动能力鉴定委员会提出再次鉴定申请。其作出的鉴定结论为最终结论。

三、特殊情况说明

• 用人单位未申请的情况：如果用人单位未在规定时间内提出工伤认定申请，工伤职工或其近亲属可以直接向设区的市级劳动能力鉴定委员会提出伤残鉴定申请，但需确保在事故伤害发生之日或被诊断、鉴定为职业病之日起1年内提出。
• 工会组织代为申请：在单位或职工个人未能及时申请时，工会组织也可以代表职工提出伤残鉴定申请，以维护职工的合法权益。

四、法律建议

• 及时申请：工伤职工或其近亲属应在工伤认定书生效后尽快申请伤残鉴定，以便及时获得赔偿。
• 准备充分：在申请前，应仔细准备所有必要的申请材料，确保材料的真实性和完整性。
• 保持沟通：在整个申请过程中，应保持与劳动能力鉴定委员会的沟通畅通，以便及时了解进展并妥善处理任何可能出现的问题。

希望以上解答能够帮助您顺利完成伤残鉴定申请。如果您在申请过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。