结论：是否会跨省抓人，不能仅根据诈骗金额和已退还部分金额来判断，这取决于多种因素，包括案件的严重性、证据的充分性、犯罪嫌疑人的行为表现以及司法机关的判断等。
分析：
案件严重性：
- 诈骗五千元，虽然从金额上看可能不构成特别重大的诈骗案件，但诈骗行为本身是违法的，且具体是否构成犯罪还需考虑其他因素，如诈骗手段、影响范围等。
- 如果案件被认定为严重，或者涉及跨地区、跨国的诈骗活动，那么司法机关可能会采取更严厉的措施，包括跨省抓人。
证据充分性：
- 司法机关在决定是否跨省抓人时，会考虑证据的充分性。如果证据确凿，能够证明犯罪嫌疑人的诈骗行为，那么跨省抓人的可能性就会增加。
- 即使已经退还了部分金额，但如果证据显示犯罪嫌疑人仍有其他诈骗行为或未退还全部金额，司法机关仍可能采取行动。
犯罪嫌疑人的行为表现：
- 如果犯罪嫌疑人在诈骗后表现出悔罪态度，积极退还诈骗所得，并配合司法机关的调查，那么司法机关可能会考虑从轻处理，不一定采取跨省抓人的措施。
- 然而，如果犯罪嫌疑人逃避调查、拒不退还诈骗所得或继续实施诈骗行为，那么司法机关很可能会采取更严厉的措施，包括跨省抓人。
司法机关的判断：
- 最终是否跨省抓人，还取决于司法机关的判断。司法机关会根据案件的具体情况、证据的充分性、犯罪嫌疑人的行为表现以及相关法律法规的规定，来综合决定是否采取跨省抓人的措施。
建议：
- 如果您或您认识的人涉及此类案件，建议尽快咨询专业律师，了解具体的法律情况和可能的法律后果。
- 配合司法机关的调查，积极退还诈骗所得，表现出悔罪态度，这有助于减轻法律责任。
- 避免逃避调查或继续实施诈骗行为，这只会加重法律责任。
可能法律后果：
- 如果构成诈骗罪，根据诈骗金额和情节严重性，可能会面临有期徒刑、拘役、管制或罚金等刑罚。
- 即使已经退还了部分金额，但如果仍构成犯罪，仍可能受到法律制裁。不过，退还金额可以作为量刑时的考虑因素之一。
总之，是否会跨省抓人取决于多种因素，不能仅凭诈骗金额和已退还部分金额来判断。如果您或您认识的人涉及此类案件，请尽快咨询专业律师以获取更具体的法律建议。