在交通事故中，关于非医保用药保险公司是否会赔偿以及法院如何判决的问题，这确实是一个涉及多方利益和法律条款的复杂议题。以下是我为您提供的详细解答：
一、非医保用药保险公司是否赔偿
保险合同约定：
- 保险公司常以保险合同中约定“不承担非医保用药费用”为由进行抗辩。然而，这一条款属于免责性质，保险公司需证明其已向投保人明确提示并说明了该条款。
- 大部分投保人通过线上以电子保单形式投保，可能对保险条款内容不了解。若保险公司无法证明已尽到明确提示和说明义务，则该条款可能不产生法律效力。
举证责任：
- 当保险公司抗辩扣除非医保用药费用时，需承担举证责任。保险公司需证明医保目录内存在同类药品或治疗项目且具有可替代性，并提供相关名称、价格。
- 若保险公司未能提供替代方式或费用差异，或提供的审核报告无相应资质、未标明可替代药品的具体名称和金额等，则法院可能不予采信其抗辩。
司法实践：
- 根据相关司法解释，医疗费用的赔付范围并未限定于医保目录之内。只要未超过医保同类费用标准，保险人仍应承担赔偿责任。
- 法院在审理此类案件时，会综合考虑保险合同约定、保险公司举证责任、医疗费用合理性及必要性等因素进行判决。
二、法院如何判决
审查保险合同：
- 法院会首先审查保险合同中有无非医保用药不赔的约定，以及保险公司是否就该条款尽到了明确的提示和说明义务。
审查举证责任：
- 法院会要求保险公司就非医保用药是否尽到举证责任进行审查。若保险公司未能提供充分证据证明非医保用药的合理性、必要性及可替代性，则法院可能不支持其抗辩。
综合判断：
- 法院会综合考虑受害人的实际医疗支出、保险合同的约定、保险公司的举证责任以及相关法律法规的规定，作出公正合理的判决。
三、具体案例分析
以您提供的案例为例，法院在审理时认为：
- 受害人的医疗费用有医院出具的医疗费单据、住院病历、费用清单等相互印证，系实际支出。
- 保险公司虽主张应扣减非医保用药费用，但未能举证反驳该部分费用的合理性、必要性，且其提交的审核报告存在瑕疵。
- 因此，法院判决保险公司承担非医保用药费用的赔付责任。
四、建议
- 投保时：投保人应仔细阅读保险合同条款，特别是免责条款部分，确保了解并同意相关内容。
- 发生事故后：及时收集并保存好相关医疗费用单据、住院病历等证据材料，以便在理赔或诉讼时提供有力支持。
- 理赔或诉讼时：若保险公司以非医保用药为由拒绝赔付，投保人可要求保险公司提供充分证据证明其抗辩的合理性、必要性及可替代性。若保险公司无法提供充分证据，则投保人可依法维护自身权益。
综上所述，非医保用药保险公司是否赔偿以及法院如何判决，取决于保险合同约定、保险公司举证责任以及相关法律法规的规定。在投保、理赔或诉讼过程中，投保人应充分了解并维护自身权益。