被侵占职工工资私下追回赔偿的协议，在符合法律规定的情况下是有效的。不过，其有效性会受到多种因素的影响，下面我将从不同角度为你详细分析：
协议有效的基本条件
双方自愿：协议必须是双方在平等、自愿的基础上达成的，没有受到任何胁迫或欺诈。这是协议有效的基本前提。
内容合法：协议的内容必须符合法律法规的规定，不能违反公序良俗。例如，协议中不能约定非法手段追回工资或赔偿，也不能约定损害第三方利益的内容。
形式合规：虽然私下协议不一定需要严格的书面形式，但为了确保协议的明确性和可证明性，建议采用书面形式，并由双方签字或盖章确认。
协议可能无效的情形
存在胁迫或欺诈：如果一方在签订协议时受到胁迫或欺诈，导致协议内容并非其真实意思表示，那么该协议可能被认定为无效。
内容违法：如果协议内容违反法律法规的强制性规定，如约定非法手段追回工资或赔偿，那么该协议将无效。
显失公平：如果协议内容显失公平，即一方利用对方处于危困状态、缺乏判断能力等情形，致使民事法律行为成立时显失公平的，受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。不过，在工资追回赔偿的协议中，这种情况相对较少见，因为双方通常都会基于实际损失和合理预期来协商赔偿金额。
法律建议
谨慎签订协议：在签订私下追回赔偿的协议前，建议双方充分沟通，明确各自的权利和义务，确保协议内容合法、合规、合理。
保留证据：无论是否签订协议，都建议保留好与工资侵占相关的证据，如工资条、银行转账记录、工作记录等。这些证据在后续维权过程中将起到关键作用。
寻求法律帮助：如果双方对协议内容或执行存在争议，或者担心协议的有效性问题，建议及时咨询专业律师，以便获得更具体的法律建议和帮助。
举例说明：假设员工A发现公司B侵占了其部分工资，经过协商，双方达成私下协议，约定公司B在一个月内支付侵占的工资及一定比例的赔偿金。如果该协议是双方自愿签订的，内容合法合规，且形式符合要求，那么该协议就是有效的。但如果公司B在签订协议时存在胁迫行为，或者协议内容违反了法律法规的强制性规定，那么该协议就可能被认定为无效。
总之，被侵占职工工资私下追回赔偿的协议在符合法律规定的情况下是有效的，但双方在签订协议时应谨慎对待，确保协议内容合法、合规、合理。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。