结论：是否扣费取决于公司政策、双方约定以及具体的情况。以下从不同角度进行分析：
公司政策与双方约定：
- 如果公司有明确的政策规定，员工参加家属体检需要承担一部分费用，并且这一政策在员工入职时或相关活动中已经明确告知员工，同时员工也同意了这一安排，那么员工在报名参加后无故不去，公司按照政策扣除相应费用是合理的。
- 如果公司政策或双方约定中并未明确提及员工不去体检会扣费，或者员工在报名时并未被告知这一后果，那么公司扣费可能缺乏依据。
费用性质与合同关系：
- 如果员工承担的费用是作为体检服务的一部分预付款或定金，且体检服务合同中明确规定了因个人原因不去体检的违约责任，那么公司可能根据合同条款扣除相应费用。
- 如果费用只是公司为了组织体检而暂时收取的，且没有明确的合同条款规定不去体检会扣费，那么公司扣费可能不合法。
实际操作与公平性：
- 从实际操作的角度看，如果公司已经为员工家属预约了体检服务，并支付了相关费用，员工突然不去可能会给公司带来一定的经济损失。在这种情况下，公司可能会根据实际情况和公平原则，要求员工承担一部分费用。
- 然而，如果公司并未因员工不去体检而产生实际经济损失，或者损失较小，那么公司扣费可能显得过于苛刻，不符合公平原则。
建议：
- 与公司沟通：首先，建议员工与公司进行沟通，了解公司扣费的具体原因和依据。如果公司政策或合同中有明确规定，员工可以与公司协商看是否能得到一定的减免或退还。
- 查看合同与政策：员工应仔细查看自己的劳动合同、公司政策以及体检服务合同等相关文件，了解自己的权利和义务。
- 寻求法律帮助：如果员工认为公司扣费不合理，且无法与公司达成一致，可以寻求法律帮助，比如向我咨询，了解自己的法律权益和可能的维权途径。
可能的法律后果：
- 如果公司扣费缺乏依据或违反了相关法律法规，员工有权要求公司退还扣费，并可能向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
- 如果员工无故不去体检且违反了合同条款，公司可能根据合同要求员工承担违约责任，但违约责任的承担也应合理合法。