员工手册中写明根据公司的经营状况可以变更员工工资标准，这一条款的合法性不能一概而论，需要分情况讨论：
若条款内容合法且程序合规：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容，包括工资标准。如果员工手册中的这一条款是在与劳动者充分协商，并得到劳动者同意的基础上制定的，且该条款本身不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么这一条款是合法的。
- 举例：假设公司在制定员工手册时，组织了员工代表大会或全体员工会议，就工资标准变更条款进行了充分讨论，并得到了大多数员工的同意，且该条款明确规定了变更工资的具体条件、程序和方式，那么这样的条款就是合法的。
若条款内容违法或程序不合规：
- 如果员工手册中的这一条款是公司单方面制定的，没有与劳动者进行协商，或者该条款违反了法律、行政法规的强制性规定，如规定了低于当地最低工资标准的工资，或者违背了公序良俗，那么这一条款就是违法的。
- 举例：假设公司未经与员工协商，直接在员工手册中规定“公司有权根据经营状况随时调整员工工资，且调整幅度由公司单方面决定”，这样的条款就可能因违反《劳动合同法》中关于变更劳动合同需协商一致的规定而被认定为违法。
法律建议：
- 对于公司而言，在制定或修改员工手册时，应确保所有条款都符合法律法规的规定，且经过与劳动者的充分协商。如果需要变更工资标准，应提前与员工进行沟通，并达成一致意见。
- 对于员工而言，如果发现员工手册中的条款存在违法或不合理之处，应及时向公司提出异议，并寻求法律帮助。如果公司未经协商单方面变更工资标准，员工有权拒绝并可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
可能的法律后果：
- 如果员工手册中的条款被认定为违法，公司可能面临劳动监察部门的处罚，如罚款、责令改正等。同时，如果公司因此与员工产生劳动纠纷，公司可能因违法条款而承担不利后果，如支付经济补偿金、赔偿金等。
总之，员工手册中关于根据公司的经营状况可以变更员工工资标准的条款，其合法性取决于条款内容是否合法以及制定程序是否合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。