结论：未满三个月老板扣一半工资的行为是违法的，相关部门调查后，您有很大机会能拿回被扣的工资。
详细分析：
法律背景：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条的规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，无论您在公司工作多久，老板都无权随意扣减您的工资。
- 如果老板扣减工资的行为没有合法依据，如未经您同意、未按照劳动合同约定或未遵循公司规章制度等，那么这种行为就构成了违法。
相关部门调查与处理：
- 当您向相关部门（如劳动监察部门）投诉老板扣减工资的行为后，相关部门会进行调查。调查过程中，您需要提供相关证据，如工资条、劳动合同、工作记录等，以证明老板确实存在扣减工资的行为。
- 如果调查证实老板确实违法扣减了您的工资，相关部门会责令老板限期支付您被扣的工资，并可能对其处以罚款等行政处罚。
您应采取的措施：
- 收集证据：首先，您需要收集所有能证明老板扣减工资的证据，包括工资条、银行转账记录、劳动合同、与老板的沟通记录等。
- 投诉举报：然后，您可以向当地的劳动监察部门投诉举报老板的违法行为。在投诉时，您需要详细描述情况，并提供相关证据。
- 寻求法律援助：如果投诉后问题仍未得到解决，或者您需要更专业的法律帮助，可以考虑咨询专业律师（比如我，侯泽英律师，专注于工伤赔偿、合同纠纷领域），了解进一步的法律途径和维权策略。
可能的结果：
- 在相关部门调查后，如果老板被证实存在违法扣减工资的行为，您将有机会拿回被扣的工资，并可能获得一定的赔偿或补偿。
- 如果老板拒绝支付或存在其他违法行为，您还可以通过法律途径（如提起劳动仲裁或诉讼）来维护自己的合法权益。
建议：
- 在与老板沟通工资问题时，尽量保持冷静和理性，避免情绪化的冲突。
- 如果可能的话，尝试与老板协商解决工资问题，以达成双方都能接受的解决方案。
- 如果协商无果或老板态度强硬，不要犹豫，及时向相关部门投诉举报并寻求法律援助。
如果您在工伤赔偿或合同纠纷方面有任何法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。