员工拒绝签两年合同是否合法，这主要取决于具体情况和劳动合同法的相关规定。以下是从不同角度进行的分析：
合同期限的合法性：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同的期限可以由用人单位和劳动者协商确定，包括固定期限、无固定期限和以完成一定工作任务为期限的劳动合同。因此，两年期的劳动合同本身并不违法，只要双方协商一致，就可以签订。
员工拒绝签订的原因：
- 如果员工拒绝签订两年期的劳动合同，是因为认为合同期限过长，或者有其他合理的理由（如个人职业规划、家庭因素等），并且这些理由在法律上并不构成拒绝签订合同的合法依据，那么员工的拒绝行为可能不构成违法，但可能会面临用人单位的不满或处理。
- 然而，如果员工拒绝签订是因为用人单位提出的合同条款存在违法、不公平或不合理的情况（如工资低于最低工资标准、不提供社会保险等），那么员工的拒绝行为是合法的，并且有权要求用人单位改正或拒绝签订。
用人单位的处理方式：
- 如果员工拒绝签订两年期的劳动合同，用人单位应当首先了解员工拒绝的原因，并尝试与员工进行协商，以达成双方都能接受的合同条款。
- 如果员工无正当理由拒绝签订，并且用人单位已经履行了告知义务（如向员工说明了合同条款、提供了必要的解释和说明等），那么用人单位可以根据劳动合同法的相关规定，与员工解除劳动关系，但可能需要支付相应的经济补偿（具体取决于员工的工作年限和解除劳动关系的具体原因）。
法律后果与建议：
- 对于员工而言，如果无正当理由拒绝签订劳动合同，可能会面临失去工作机会或需要承担一定的法律责任（如赔偿用人单位因招聘、培训等产生的费用）。
- 对于用人单位而言，如果员工拒绝签订劳动合同，应当谨慎处理，避免违法解除劳动关系或侵犯员工的合法权益。建议用人单位在处理此类情况时，咨询专业律师的意见，以确保合法合规。
总结来说，员工拒绝签两年合同是否合法，取决于拒绝的原因和具体情况。如果员工有合理的理由并且合同条款合法公平，那么拒绝行为可能是合法的；如果无正当理由拒绝或合同条款存在违法情况，那么可能需要承担相应的法律后果。在任何情况下，建议双方都保持沟通，并尝试通过协商解决问题。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。