结论：员工签两年合同到期，用人单位不续签是否违法，需根据具体情况判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、一般情况下的合法性分析
合同自由原则：
- 在劳动合同到期后，用人单位和劳动者均有权选择是否续签劳动合同。如果双方均同意不续签，那么劳动关系自然终止，此时并不构成违法行为。这是基于合同自由原则，即双方都有权在合同期满时决定是否继续履行合同。
经济补偿的支付：
- 若用人单位决定不续签劳动合同，且不属于维持或提高劳动合同约定条件而劳动者不同意续订的情形，则用人单位应向劳动者支付经济补偿金。补偿标准按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资。
- 计算公式：经济补偿金 = 工作年限 × 月工资（月工资高于当地职工月平均工资三倍的，按三倍计算，且支付年限最高不超过十二年）。
二、特殊情况下的违法判断
无固定期限劳动合同的签订：
- 根据《劳动合同法》的规定，连续订立二次固定期限劳动合同后，若劳动者没有严重违反用人单位规章制度（即不存在《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条规定的情形）或不能胜任工作经培训或调岗仍不能胜任（即第四十条第一项、第二项规定的情形），在续订劳动合同时，除劳动者提出订立固定期限劳动合同外，应当订立无固定期限劳动合同。
- 如果劳动者符合上述条件，而用人单位拒绝与其签订无固定期限劳动合同，那么用人单位的行为将违反法律规定，侵害了劳动者的合法权益。
哺乳期女职工保护：
- 用人单位在女职工哺乳期内不得解除或终止劳动合同，包括不续签。违反此规定属于违法解除或终止劳动合同，需承担相应法律后果，如支付赔偿金等。
不正当手段的禁止：
- 在续签劳动合同的过程中，如果用人单位采用欺诈、胁迫等不正当手段，使劳动者在违背真实意思的情况下不续签劳动合同，那么这也可能构成违法行为。
三、法律建议
对于用人单位：
- 在决定不续签劳动合同时，应仔细审查劳动者的合同期限、工作表现以及是否符合签订无固定期限劳动合同的条件。
- 如果决定不续签，应依法向劳动者支付经济补偿金，并办理相关离职手续。
- 避免采用欺诈、胁迫等不正当手段迫使劳动者不续签劳动合同。
对于劳动者：
- 如果认为自己符合签订无固定期限劳动合同的条件，且用人单位无故拒绝续签，可以依法维护自己的权益，要求用人单位继续履行劳动合同或支付相应的经济补偿。
- 在续签劳动合同时也应保持警惕，仔细阅读合同条款，避免被用人单位的不正当手段所误导。
法律依据：
- 《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条、第四十条、第四十六条、第四十七条等相关规定。
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