针对您提出的“重大疾病员工怎么解除劳动合同”的问题，这确实是一个涉及劳动者权益保护和用人单位管理规定的复杂议题。以下是我根据相关法律法规，为您提供的详细解答：
一、医疗期内的保护
首先，需要明确的是，根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法规，劳动者在患病或非因工负伤时，享有一定的医疗期。在医疗期内，用人单位是不得解除劳动合同的。这是为了保障劳动者有足够的时间进行治疗和恢复，避免因疾病而失去工作保障。医疗期的长短会根据劳动者的实际工作年限和在本单位的工作年限来确定，范围通常在3个月至24个月不等。
二、医疗期满后的处理
用人单位解除劳动合同的条件：
- 医疗期满后，如果劳动者不能从事原工作，且经用人单位另行安排后仍不能胜任，那么用人单位有权解除劳动合同。但这一过程必须遵循严格的法律程序。
解除劳动合同的程序：
- 用人单位需要提前三十日以书面形式通知劳动者本人，或者额外支付劳动者一个月工资后，方可解除劳动合同。这是为了保障劳动者的知情权及合理的准备时间。
经济补偿：
- 在此情形下解除劳动合同，用人单位必须按照法律规定向劳动者支付经济补偿金。补偿标准通常按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资，六个月以上不满一年的按一年计算，不满六个月的支付半个月工资。
三、劳动者解除劳动合同的权利
主动辞职：
- 劳动者无论是否在医疗期内，均有权主动提出解除劳动合同。但需注意，主动辞职的情况下，用人单位通常无需支付经济补偿金。
被迫解除：
- 如果用人单位存在未提供劳动保护、未及时足额支付劳动报酬、未依法缴纳社会保险费等违法行为，劳动者有权随时解除劳动合同，并要求用人单位支付经济补偿金。
四、特殊情况与注意事项
- 如果劳动者患的是职业病或因工负伤并被确认丧失或部分丧失劳动能力，或者处于孕期、产期、哺乳期等特定情况，用人单位是不得依据上述规定解除劳动合同的。
- 由于法律法规可能因地区而异，具体条款和解释可能有所不同。因此，在实际操作中，我建议您咨询当地律师或法律援助机构以获取更准确的法律建议。
五、综合建议
在处理涉及重大疾病的劳动合同时，无论是用人单位还是劳动者，都应细致分析劳动者的医疗期、工作能力、用人单位的规章制度及劳动合同的履行情况。用人单位应遵守法律规定，合理处理与患病劳动者的劳动关系；劳动者也应了解自身权益，必要时可寻求专业法律帮助。
希望以上解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时告诉我。