核心结论：司机死亡后的责任归属与实际车主是否有关，需分情况讨论，主要取决于司机与挂靠公司、实际车主之间的法律关系，以及事故发生的具体原因。以下是具体分析：

1. 若司机与挂靠公司构成劳动关系
   根据《工伤保险条例》及《最高人民法院关于审理工伤保险行政案件若干问题的规定》，若司机与挂靠公司存在事实劳动关系（如挂靠公司实际管理司机、发放工资等），即使未缴纳工伤保险，挂靠公司仍需承担工伤保险责任。此时，司机死亡属于工伤，赔偿主体为挂靠公司，与实际车主无直接法律关系。但若实际车主对事故存在过错（如指使司机违规操作），可能需承担连带赔偿责任。

2. 若司机与实际车主构成雇佣关系
   若司机受实际车主雇佣，双方形成劳务关系，则根据《民法典》第1192条，司机因工作死亡时，实际车主需承担雇主责任（如赔偿丧葬费、死亡赔偿金等）。此时，挂靠公司未缴纳工伤保险的行为可能构成违规，但司机家属仍需优先向实际车主主张赔偿；若挂靠公司存在过错（如允许无资质车辆挂靠），可能需承担补充责任。

3. 若司机自身存在重大过错
   若司机死亡系因自身故意或重大过失导致（如酒驾、无证驾驶等），根据《民法典》第1173条，实际车主或挂靠公司的赔偿责任可能减轻或免除。但需注意，若挂靠公司未履行安全监管义务（如未检查司机资质），仍需承担相应责任。

关键建议：

• 实际车主应立即固定证据（如雇佣合同、事故认定书、医疗记录等），明确法律关系；
  
• 若挂靠公司拒绝赔偿，可同时起诉挂靠公司和实际车主，要求法院根据过错比例划分责任；
  
• 司机家属可申请劳动仲裁或直接起诉，主张工伤赔偿或人身损害赔偿（二者竞合时需择一主张）。
  

温馨提示：此类案件涉及劳动关系认定、过错划分等复杂问题，建议携带材料与我进一步沟通，以便制定具体维权方案。