法院协助执行通知扣发工资是合法的，但需满足一定条件并遵循法定程序。以下从多个角度为你详细分析：
一、法律依据与合法性基础
根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释的规定，法院在执行过程中，有权向有关单位发出协助执行通知书，要求其协助查询、冻结、划拨被执行人的财产，包括工资收入。这是法院行使执行权的一种重要方式，旨在保障生效法律文书的顺利执行，维护当事人的合法权益。因此，从法律层面讲，法院协助执行通知扣发工资是合法的。
二、扣发工资的条件与程序
存在生效法律文书：法院扣发工资的前提是存在已经生效的法律文书，如判决书、裁定书等，且该法律文书确定了被执行人应履行的义务。
被执行人未履行义务：被执行人未按生效法律文书确定的期限和方式履行义务，是法院采取扣发工资等执行措施的前提条件。
法院发出协助执行通知书：法院在查明被执行人的工资收入情况后，会向被执行人所在单位发出协助执行通知书，要求其协助扣发被执行人的工资。
保留必要生活费用：在扣发工资时，法院会考虑被执行人的基本生活需要，为其保留必要的生活费用。这是为了保障被执行人的基本生活权益，避免执行措施过于严厉导致被执行人生活陷入困境。
三、扣发工资的注意事项
扣发比例与限额：虽然法律没有明确规定扣发工资的具体比例和限额，但法院在执行过程中会综合考虑被执行人的实际情况和当地的生活水平，合理确定扣发比例和限额。
异议处理：如果被执行人或其所在单位对法院的扣发工资决定有异议，可以向法院提出书面异议。法院会依法进行审查，并作出相应的处理决定。
执行监督：法院在执行过程中会接受社会各界的监督，确保执行措施的合法性和公正性。如果发现执行过程中存在违法行为或不当行为，可以向法院反映或投诉。
四、可能面临的法律后果
如果被执行人或其所在单位拒不履行法院的协助执行通知书，可能会面临以下法律后果：
罚款：法院可以对拒不履行协助执行义务的单位或个人处以罚款。
拘留：在情节严重的情况下，法院可以对拒不履行协助执行义务的单位负责人或个人采取拘留措施。
追究刑事责任：如果拒不履行协助执行义务的行为构成犯罪，如拒不执行判决、裁定罪等，法院会依法追究其刑事责任。
总结与建议：法院协助执行通知扣发工资是合法的，但需满足一定条件并遵循法定程序。如果你或你所在单位收到了法院的协助执行通知书，建议积极配合法院的执行工作，避免不必要的法律纠纷。如果你对扣发工资的决定有异议或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。