员工可先通过友好协商解决，若协商不成，可依据相关证据通过法律途径追讨垫付款项。具体分析如下：

1. 友好协商：

   • 尝试沟通：员工应首先尝试与公司进行友好协商，明确表达自己的诉求，即要求公司归还垫付的款项。在协商过程中，可以提供相关的付款凭证，如发票、收据、转账记录等，以证明自己确实为公司垫付了款项。
   • 协商结果：如果公司同意归还垫付款项，双方可以签订一份书面协议，明确还款金额、还款期限等条款，以确保双方的权益得到保障。

2. 法律途径：

   • 收集证据：如果协商无果，员工需要收集充分的证据来证明自己为公司垫付了款项。这些证据应包括付款凭证、与公司沟通的记录（如邮件、短信、微信聊天记录等）、公司承认垫付款项的书面或口头证据等。
   • 提起诉讼或申请仲裁：
     • 诉讼：员工可以向法院提起诉讼，要求公司归还垫付款项。在诉讼过程中，员工需要提交上述收集的证据，以证明自己的诉求。法院将根据事实和法律规定，作出判决。
     • 仲裁：如果员工与公司之间有仲裁协议，员工也可以选择向仲裁机构申请仲裁。仲裁机构将根据双方提交的证据和仲裁规则，作出裁决。
   • 执行判决或裁决：如果法院或仲裁机构判决或裁决公司归还垫付款项，但公司拒不履行，员工可以向法院申请强制执行。法院将依法采取强制措施，如查封、扣押、拍卖等，以强制公司履行还款义务。

3. 注意事项：

   • 保留证据：员工在为公司垫付款项时，应务必保留好相关证据，以便在需要时证明自己的权益。
   • 及时行动：如果公司长时间不归还垫付款项，员工应及时采取行动，通过法律途径追讨，以免超过诉讼时效或仲裁时效。
   • 寻求专业帮助：在处理此类纠纷时，员工可以寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到充分保障。