电站运行电工超出44小时才算加班并不合法。以下从多个角度为你详细分析：

法律规定的工作时长与加班认定

根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者每日工作时间不超过8小时，平均每周工作时间不超过44小时（但需注意，自1995年5月1日起，我国已实行每日工作不超过8小时、平均每周工作不超过40小时的标准工时制，44小时的规定已逐渐被40小时所取代，不过在特定行业或特殊情况下，44小时仍可能作为参考）。重要的是，无论标准是40小时还是44小时，超出部分均应视为加班，用人单位需支付加班费或安排补休。

对于电站运行电工这类特殊工种，如果其工作性质确实需要实行不定时工作制或综合计算工时工作制，那么加班的认定和计算方式可能会有所不同。但即便如此，超出法定工作时间的部分仍然需要得到相应的补偿，不能简单地以“超出44小时才算加班”为标准。

加班费的计算与支付

如果电站运行电工确实存在加班情况，用人单位应按照以下标准支付加班费：

1. 工作日加班：支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
2. 休息日加班：如果不能安排补休，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
3. 法定节假日加班：支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。

特殊工时制度的适用与审批

如果电站运行电工的工作性质适合实行不定时工作制或综合计算工时工作制，用人单位需要向当地劳动保障行政部门提出申请，并获得批准后才能实施。未经批准擅自实行特殊工时制度是违法的，用人单位仍需按照标准工时制支付加班费。

维权建议

如果你作为电站运行电工，发现用人单位存在违法加班或未支付加班费的情况，可以采取以下措施维护自己的合法权益：

1. 与用人单位协商：首先尝试与用人单位沟通，要求其按照法律规定支付加班费或安排补休；
2. 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉，要求其介入调查并处理；
3. 申请劳动仲裁：如果对劳动监察部门的处理结果不满意，还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径维护自己的权益。

综上所述，电站运行电工超出44小时（或更常见的40小时）才算加班的说法是不合法的。如果你遇到类似情况，建议及时与用人单位沟通或寻求法律帮助。有问题可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。