在计算工资时，法定休息日通常不计入应出勤天数，而是作为带薪休假处理。以下是对这一问题的详细分析：
一、法定休息日的性质
法定休息日，如周末（周六、周日）以及国家法定节假日，是劳动者依法享有的休息时间。根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，劳动者在法定休息日享有休息的权利，用人单位应当安排劳动者休息，并不得因此扣减工资。
二、工资计算的基本原则
日工资计算：日工资通常是通过月工资总额除以月计薪天数来计算的。月计薪天数是指劳动者在一个月内应当出勤的天数，它排除了法定节假日和休息日（如果休息日不安排工作且不计薪的话，但实际操作中，多数情况下休息日是带薪的，即不计入缺勤也不扣减工资）。根据原劳动和社会保障部《关于职工全年月平均工作时间和工资折算问题的通知》，月计薪天数为21.75天（（365天-104天休息日-11天法定节假日）÷12个月）。
应出勤天数：应出勤天数是指劳动者在一个月内实际应当出勤的天数，它通常不包括法定节假日和用人单位安排的休息日（如果这些休息日劳动者确实休息了且不计薪的话，但如前所述，多数情况下休息日是带薪的）。然而，在实际操作中，如果劳动者在休息日加班，则应当按照法律规定支付加班费，但这并不改变休息日本身不计入应出勤天数的事实。
三、法定休息日是否计入应出勤天数的具体分析
不计入应出勤天数的情况：在大多数情况下，法定休息日不计入应出勤天数。这是因为劳动者在法定休息日享有休息的权利，且用人单位不得因此扣减工资。因此，在计算工资时，法定休息日通常被视为带薪休假，不计入缺勤天数，也不因此扣减工资。
特殊情况：如果劳动者在法定休息日加班，则应当按照法律规定支付加班费。但这并不改变法定休息日本身不计入应出勤天数的事实。加班费是额外支付的报酬，用于补偿劳动者在休息日工作的额外付出。
四、实际操作建议
明确工资计算方式：用人单位应当在劳动合同或规章制度中明确工资的计算方式，包括日工资的计算、应出勤天数的确定以及加班费的支付等。这有助于避免因工资计算问题引发的劳动争议。
遵守法律法规：用人单位在计算工资时，应当严格遵守《中华人民共和国劳动法》等相关法律法规的规定，确保劳动者的合法权益得到保障。
及时沟通解释：如果劳动者对工资计算方式有疑问或不满，用人单位应当及时与劳动者进行沟通解释，消除误解和疑虑。
总结来说，法定休息日通常不计入应出勤天数，而是作为带薪休假处理。用人单位在计算工资时应当遵守相关法律法规的规定，确保劳动者的合法权益得到保障。如果你对工资计算还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。