关于员工不上班自动离职是否需要办手续的问题，这实际上涉及到了劳动合同解除和离职管理的相关法律规定及实践操作。
首先，需要明确的是，在《劳动合同法》实施之后，已经不存在“自动离职”这一法律概念。当员工出现不上班、擅自离岗等情形时，用人单位不能直接认定双方劳动关系已经解除，而应当将这些情形纳入到离职管理的范畴。
对于员工而言：
应当办理离职手续：即使在劳动合同有效期内且公司无违法行为的情况下，员工如果打算离职，都应该按照公司规定的离职交接流程办理离职手续。这包括但不限于提交离职申请、交接工作、结清财务等。
避免造成损失：如果员工未按规定办理离职手续，给用人单位造成损失的，用人单位有权基于法律规定要求劳动者赔偿损失。这可能包括但不限于因员工擅自离职导致的业务中断、客户流失、招聘新员工产生的费用等。
对于用人单位而言：
确认员工擅自离岗：用人单位需要确认员工未按规定履行请假手续而擅自离岗，且无正当理由。这是用人单位作出解除劳动合同决定的前提。
联系员工上班：在确认员工擅自离岗后，用人单位应通过各种渠道联系员工上班，如准备通知信寄往员工的任何地址，并保留签收证据，最好使用挂号信。这是为了证明用人单位已经尽到了通知义务。
作出解除劳动合同决定：如果员工在合理期限内仍未返回工作岗位，用人单位可以基于劳动者擅自离岗这一事实行为作出解除劳动合同的决定。
结清工资和办理社保手续：在解除劳动合同后，用人单位需要结清员工的工资，并办理好社保手续，确保员工的合法权益得到保障。
保留相关资料：用人单位还需要保留好员工所有的档案及相关资料，如完备的考勤表、离职申请、解除劳动合同通知书等，以备不时之需。
综上所述，员工不上班自动离职并不意味着可以免除办理离职手续的责任。无论是员工还是用人单位，都应该遵循相关法律法规和公司规定，妥善处理离职事宜，以避免不必要的法律纠纷和经济损失。