结论：事业单位退休后单位一次性补交企业社保是否合法，需分情况讨论，关键在于补缴行为是否符合现行法律法规及政策规定，且需结合补缴主体、补缴程序、补缴范围等因素综合判断。以下从不同角度展开分析：

1. 补缴主体与性质：事业单位是否可补缴企业社保？

• 事业单位社保与企业社保的差异：事业单位原实行机关事业单位养老保险制度（“老机保”），与企业职工养老保险制度（“企保”）在缴费基数、比例、待遇计算等方面存在差异。2014年10月起，机关事业单位养老保险制度改革（“并轨”），新入职人员纳入企保，但“老人”“中人”仍可能涉及过渡性政策。
• 补缴的合法性前提：若退休人员原属事业单位编制，且单位未依法为其缴纳改革前的养老保险（如“老机保”未足额缴纳），则单位需按政策补缴至对应社保账户（如机关事业养老保险基金），而非直接补缴至企业社保。若单位错误将其纳入企保并补缴，可能涉及程序违法。
• 例外情形：若退休人员已通过调动、离职等方式转入企业身份，或单位自愿为其按企保标准补缴（如补充养老保险），需符合当地政策且经社保部门审核同意，否则可能被认定为违规操作。

2. 补缴程序与依据：是否符合法定流程？

• 补缴的法定条件：根据《社会保险法》第六十三条，用人单位未按时足额缴纳社保费的，由社保征收机构责令补缴。若单位主动补缴，需满足以下条件：
  • 存在历史欠费记录（如未缴、少缴期间有工资发放记录）；
  • 补缴期间与劳动关系存续期间一致；
  • 补缴基数、比例符合当地规定（如按社平工资的60%-300%确定）。
• 一次性补缴的限制：多数地区已禁止企业以“一次性补缴”方式规避长期缴费义务（如人社部发〔2016〕132号文），但事业单位改革过渡期内可能存在例外政策（如针对“中人”的视同缴费年限补缴）。若单位以“一次性补缴”名义为退休人员虚构劳动关系或缴费年限，则涉嫌违法。

3. 补缴范围与待遇影响：是否损害退休人员权益？

• 社保账户的独立性：机关事业养老保险与企业养老保险分属不同账户，资金互不挤占。若单位将应补缴至机关事业账户的资金错误缴入企保账户，可能导致退休人员待遇计算错误（如基础养老金、职业年金缺失）。
• 待遇核定依据：退休人员养老金由社保部门根据其缴费年限、缴费基数、个人账户余额等核定。若补缴行为未被社保系统记录（如未提供完整档案材料），可能影响待遇领取；若补缴后待遇提高，需确认是否符合“多缴多得”原则。

4. 合规建议：如何避免法律风险？

• 对单位：
  1. 核查退休人员人事档案，明确其身份属性（编制内/外、改革前/后入职）；
  2. 咨询当地社保部门，确认补缴政策（如是否允许跨制度补缴、需提供哪些材料）；
  3. 严格按社保部门核定的基数、年限补缴，避免虚构劳动关系或违规操作。
• 对退休人员：
  1. 要求单位提供社保部门出具的补缴凭证，核实资金流向；
  2. 若发现补缴后待遇异常，及时向社保部门申诉或申请行政复议；
  3. 保留与单位的沟通记录（如邮件、书面协议），作为维权证据。

总结：事业单位退休后单位一次性补交企业社保的合法性需结合身份属性、补缴程序、政策依据综合判断。若涉及违规操作，可能面临社保部门追缴、行政处罚甚至刑事责任（如诈骗社保基金）。建议单位与退休人员共同咨询当地社保部门，确保补缴行为合法合规。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体细节。