若原审依据的鉴定意见被撤销，当事人可依据《中华人民共和国民事诉讼法》第二百零七条（原第二百条）第（一）项“有新的证据，足以推翻原判决、裁定的”或第（三）项“原判决、裁定认定事实的主要证据是伪造的”等情形申请再审。以下是具体分析：

1. 以“新证据”为由申请再审
   鉴定意见被撤销后，若原鉴定意见是原审认定事实的关键证据，且撤销后出现与原鉴定结论相反的新证据（如重新鉴定的合法意见），可依据《民事诉讼法》第二百零七条第（一）项申请再审。此时需满足：

   • 新证据需在原审庭审结束后形成，或虽形成于原审前但因客观原因无法取得；
     
   • 新证据足以推翻原判决、裁定认定的基本事实或裁判结果。
     操作建议：立即委托专业机构重新鉴定，确保新鉴定程序合法、依据充分，并在再审申请中重点论证新证据与原判决的关联性及证明力。

2. 以“主要证据系伪造”为由申请再审
   若鉴定意见被撤销的原因是原鉴定机构或人员存在伪造、篡改数据等违法行为，可依据《民事诉讼法》第二百零七条第（三）项申请再审。此时需满足：

   • 原鉴定意见是原审认定事实的“主要证据”；
     
   • 有充分证据证明原鉴定意见系伪造（如鉴定机构违规操作记录、专家论证意见等）。
     操作建议：收集原鉴定机构违法操作的证据（如鉴定档案、行业处罚决定等），并通过书面质证材料向法院证明原鉴定意见的非法性。

3. 以“违反法定程序”为由申请再审（补充情形）
   若原鉴定意见因程序违法被撤销（如鉴定机构无资质、鉴定人未回避等），且该程序违法可能影响案件公正审理，可依据《民事诉讼法》第二百零七条第（七）项“审判组织的组成不合法或者依法应当回避的审判人员没有回避的”或第（九）项“违反法律规定，剥夺当事人辩论权利的”等程序性条款申请再审。
   操作建议：重点审查原审鉴定委托、鉴定过程、质证环节是否存在程序瑕疵，并在再审申请中明确指出程序违法与实体裁判的因果关系。

风险提示与实务建议：

• 时效限制：再审申请需在判决、裁定生效后六个月内提出，若存在新证据或原鉴定意见被撤销等情形，可自知道或应当知道之日起计算。
  
• 证据固定：及时通过公证、专家辅助人意见等方式固定新证据，避免证据灭失风险。
  
• 策略选择：若原鉴定意见被撤销但无直接反证，可优先以“程序违法”为由申请再审，降低举证难度；若有充分反证，则以“新证据”为由更直接有效。
  

如需进一步分析案件细节或制定再审策略，可直接向我咨询，我会结合具体案情提供针对性建议。