在被害人申请重新鉴定期间，检察院不一定会做出存疑不起诉决定。这主要取决于案件的具体情况、证据的充分性以及法律的规定。以下是对这一问题的详细分析：
一、存疑不起诉的决定条件
存疑不起诉，也称为证据不足不起诉，是指检察院在审查起诉阶段，经过两次补充侦查后，认为证据仍然不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉决定。这一决定的关键在于证据的充分性和证明力。如果证据不足以支持指控的犯罪事实，或者证据之间存在矛盾无法排除合理怀疑，那么检察院就可能会作出存疑不起诉的决定。
二、重新鉴定对存疑不起诉决定的影响
重新鉴定的目的：
- 重新鉴定通常是在原有鉴定存在疑问或争议时进行的，旨在通过更专业、更权威的鉴定机构或专家对案件中的某些关键证据进行再次鉴定，以获取更准确、更可靠的鉴定结论。
重新鉴定与存疑不起诉的关系：
- 重新鉴定本身并不直接决定检察院是否作出存疑不起诉决定。但是，如果重新鉴定的结果对原有鉴定结论产生了重大影响，甚至推翻了原有鉴定结论，那么这可能会影响到案件的证据充分性和证明力。
- 如果重新鉴定后，证据仍然不足或存在矛盾无法排除合理怀疑，那么检察院就可能会考虑作出存疑不起诉决定。
重新鉴定期间的程序处理：
- 在被害人申请重新鉴定期间，案件通常会处于中止审查或延期审查的状态。这是因为重新鉴定需要一定的时间来完成，而在这段时间内，检察院无法对案件作出最终的起诉或不起诉决定。
- 但是，这并不意味着在重新鉴定期间检察院一定会作出存疑不起诉决定。检察院会根据案件的具体情况和证据的充分性来综合判断是否需要继续补充侦查或等待重新鉴定结果后再作决定。
三、其他可能影响存疑不起诉决定的因素
案件性质：
- 不同性质的案件对证据的要求和证明标准可能有所不同。例如，对于一些严重的暴力犯罪案件，检察院可能会对证据的要求更为严格，需要更多的证据来支持指控的犯罪事实。
证据收集情况：
- 除了鉴定结论外，案件中的其他证据如证人证言、物证、书证等也会影响到检察院的起诉决定。如果这些证据能够相互印证、形成完整的证据链，那么即使重新鉴定结果存在疑问，检察院也可能不会作出存疑不起诉决定。
法律政策变化：
- 法律政策的变化也可能影响到检察院的起诉决定。例如，如果新的法律政策对某类犯罪的打击力度加大或减小，那么检察院在审查起诉时可能会相应地调整其起诉标准。
四、建议
- 对于被害人：如果被害人对原有鉴定结论存在疑问并申请了重新鉴定，那么应该积极配合鉴定机构的工作，提供必要的证据和材料。同时，也可以关注案件的审查进展情况，及时与检察院沟通了解案件的处理结果。
- 对于犯罪嫌疑人或被告人：如果案件涉及重新鉴定且可能面临存疑不起诉的情况，那么应该积极与律师沟通，了解案件的具体情况和法律政策的变化。同时，也可以准备相关的证据和材料来支持自己的辩护观点。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。