检察院存疑不起诉后，案件不一定会被撤销，而是根据具体情况来决定。以下是对此问题的详细分析：
一、存疑不起诉的基本概念
存疑不起诉，即检察机关在审查起诉阶段，对于经过补充侦查的案件，仍然认为证据不足、不符合起诉条件的，依法作出的不起诉决定。这种决定并不等同于案件的最终撤销，而是表示在当前阶段，由于证据不足，无法对犯罪嫌疑人提起公诉。
二、存疑不起诉后案件的可能处理方式
不撤销的常规情况：
- 公安机关一般不会立即撤销案件，因为存疑不起诉仅表示现有证据不足以证明犯罪嫌疑人有罪，并不完全排除其犯罪可能性。公安机关可能会选择将案件继续挂起，等待后续可能出现的新的证据情况再作进一步决定。
可能撤销的情况：
- 新证据证明无罪：若后续侦查中发现新证据，能确凿证明犯罪嫌疑人未实施犯罪行为，公安机关应撤销案件。
- 超过追诉时效：如案件已超过法律规定的追诉时效，公安机关亦会撤销案件。
公安机关的后续工作：
- 公安机关若认为未来可能通过补充侦查获取新证据，达到起诉标准，可继续进行侦查工作。一旦收集到足够证据，可重新移送审查起诉。
三、特定情况下的撤销程序
一般情况下的撤销：
- 依据《中华人民共和国刑事诉讼法》及《人民检察院刑事诉讼规则》，对于二次补充侦查后仍认为证据不足、不符合起诉条件的案件，人民检察院应作出不起诉决定，并通知公安机关撤销案件。但这一规定并不意味着所有存疑不起诉的案件都会立即撤销，而是需要公安机关根据具体情况来决定。
公安机关的异议处理：
- 若公安机关认为不起诉决定有错误，可要求复议或提请上一级人民检察院复核。
- 如公安机关在收到不起诉决定书后超过十五日未提出异议，也未撤销案件或终止侦查，人民检察院将发出纠正违法通知书。若公安机关仍不纠正，则需报上一级人民检察院协商同级公安机关处理。
四、实际案例与法律效果
在实际操作中，存疑不起诉后案件是否撤销，往往取决于公安机关对案件后续发展的判断。如果公安机关认为有继续侦查的必要，且有可能收集到新的证据，那么案件可能会继续挂起；如果公安机关认为案件已经没有继续侦查的价值，或者已经超过了追诉时效，那么案件可能会被撤销。
总结：检察院存疑不起诉后，案件是否会被撤销并非一成不变，而是根据具体情况和法律规定来决定。如果您或您身边的人遇到了类似的问题，建议直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。