检察院不起诉公安机关并不一定会撤案，这需要根据具体情况来分析。
一. 法定不起诉情况下的撤案处理
- 当检察院作出法定不起诉的决定时，意味着犯罪嫌疑人的行为不构成犯罪或者依法不应追究刑事责任。根据《刑事诉讼法》第一百七十七条，对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。在此情形下，公安机关会基于检察院的决定，对案件进行撤案处理，同时解除对犯罪嫌疑人所采取的相关强制措施，使案件得以终结。
- 例如，若某犯罪嫌疑人因涉嫌轻微盗窃被逮捕，但检察院审查后认为其犯罪情节轻微，可免除刑罚，决定不起诉。此时，公安机关应撤案并释放犯罪嫌疑人。
二. 存疑不起诉情况下的案件处理
- 存疑不起诉是检察院在证据不足、不符合起诉条件的情况下所作出的决定。对于这类案件，公安机关一般不会立即撤案，而是选择将案件继续挂起，等待后续可能出现的新的证据情况再作进一步决定。根据《刑事诉讼法》第一百七十五条，对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。若日后发现了新的且足以支持起诉的证据，公安机关有权重新立案侦查。
- 例如，若某犯罪嫌疑人因涉嫌诈骗被逮捕，但检察院因证据不足决定不起诉。此时，公安机关不会立即撤案，而是会等待新的证据出现。若后续找到确凿证据，公安机关可重新立案侦查。
三. 被害人的司法救济途径
值得注意的是，即使检察院作出了不起诉决定，并且公安机关已经撤案，被害人仍然有可能通过司法途径寻求救济。根据《刑事诉讼法》第一百八十条，被害人如果不服检察院的不起诉决定，可以自收到决定书后七日以内向上一级人民检察院申诉，请求提起公诉。人民检察院应当将复查决定告知被害人。对人民检察院维持不起诉决定的，被害人可以向人民法院起诉。
综上所述，检察院不起诉后公安机关是否会撤案，并非一概而论，而是需要根据具体的不起诉类型以及案件的实际情况来决定。在法定不起诉的情况下，公安机关会撤案；而在存疑不起诉的情况下，案件则可能会被暂时挂起以待后续证据的出现。如有进一步需要，您可以继续咨询我。