公司扣双倍工资一般是不合法的。以下从不同角度为你详细分析：
合法性分析
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这意味着，公司扣除工资必须基于合法、合理的理由，并且扣除的金额和方式必须符合法律规定。
- 通常情况下，公司无权随意扣除员工的工资，更不用说扣除双倍工资了。除非员工存在严重违反公司规章制度、给公司造成重大损失等特定情形，且公司能够证明这些情形的存在以及扣除工资的合理性，否则公司扣除双倍工资的行为很可能构成违法。
扣除工资的合法情形：
- 即便是在员工存在过错或给公司造成损失的情况下，公司扣除工资也应当遵循一定的原则和限制。例如，扣除的金额不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。
- 此外，公司扣除工资前应当与员工进行协商，并告知扣除的原因和金额。如果公司未经协商或未告知员工就擅自扣除双倍工资，那么这种行为很可能被视为违法。
可能的法律后果
员工维权：
- 如果公司扣除双倍工资的行为被认定为违法，员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司补发被扣除的工资，并可能获得相应的经济补偿。
公司责任：
- 公司除了需要补发被扣除的工资外，还可能面临劳动监察部门的处罚，如罚款、责令改正等。在严重的情况下，公司的违法行为还可能被公开曝光，对公司的声誉和形象造成负面影响。
建议与措施
与公司沟通：
- 如果你发现公司扣除了你的双倍工资，首先应当与公司进行沟通，了解扣除的原因和依据。如果公司无法提供合理的解释或依据，你可以向公司提出异议，并要求公司补发被扣除的工资。
寻求法律援助：
- 如果与公司沟通无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。在投诉或申请仲裁前，建议你收集好相关证据，如工资条、劳动合同、公司规章制度等，以便更好地维护自己的权益。
了解法律知识：
- 为了更好地维护自己的权益，建议你了解一些基本的劳动法律知识。这样，在遇到类似问题时，你就能更加从容地应对，并知道如何寻求法律援助。
总之，公司扣双倍工资一般是不合法的。如果你遇到了这种情况，不要慌张，先与公司进行沟通，了解扣除的原因和依据。如果沟通无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。